Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP4P12644 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP4P12644 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BMP4P12644 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP4P12644 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP4P12644 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP4P12644 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms