RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555540.1

KRT18P6-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 6, humanhuman

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Gene KRT18P6, Length 1,265 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P6-201ENST00000555540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.32■■■■■ 5.81
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KRT18P6-201ENST00000555540 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.12■■■■■ 4.97
KRT18P6-201ENST00000555540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.92■■■■■ 4.62
KRT18P6-201ENST00000555540 NACADO15069 1562 aa43.6■■■■■ 4.57
KRT18P6-201ENST00000555540 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.34■■■■■ 4.53
KRT18P6-201ENST00000555540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.29■■■■■ 4.52
KRT18P6-201ENST00000555540 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.98■■■■■ 4.47
KRT18P6-201ENST00000555540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.97■■■■■ 4.47
KRT18P6-201ENST00000555540 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.92■■■■■ 4.46
KRT18P6-201ENST00000555540 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.65■■■■■ 4.42
KRT18P6-201ENST00000555540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
KRT18P6-201ENST00000555540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.41■■■■■ 4.38
KRT18P6-201ENST00000555540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.08■■■■■ 4.33
KRT18P6-201ENST00000555540 SCRIBQ14160 1630 aa41.98■■■■■ 4.31
KRT18P6-201ENST00000555540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.7■■■■■ 4.27
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
KRT18P6-201ENST00000555540 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.58■■■■■ 4.25
KRT18P6-201ENST00000555540 NCAPD3P42695 1498 aa40.24■■■■■ 4.03
KRT18P6-201ENST00000555540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.1■■■■■ 4.01
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KRT18P6-201ENST00000555540 SMARCA2P51531 1590 aa40■■■■□ 3.99
KRT18P6-201ENST00000555540 HMGXB3Q12766 1538 aa39.96■■■■□ 3.99
KRT18P6-201ENST00000555540 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.86■■■■□ 3.97
KRT18P6-201ENST00000555540 ERCC6Q03468 1493 aa39.85■■■■□ 3.97
KRT18P6-201ENST00000555540 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
KRT18P6-201ENST00000555540 CUX2O14529 1486 aa39.82■■■■□ 3.97
KRT18P6-201ENST00000555540 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
KRT18P6-201ENST00000555540 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.69■■■■□ 3.94
KRT18P6-201ENST00000555540 NESP48681 1621 aa39.62■■■■□ 3.93
KRT18P6-201ENST00000555540 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.53■■■■□ 3.92
KRT18P6-201ENST00000555540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.37■■■■□ 3.89
KRT18P6-201ENST00000555540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
KRT18P6-201ENST00000555540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.16■■■■□ 3.86
KRT18P6-201ENST00000555540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.12■■■■□ 3.85
KRT18P6-201ENST00000555540 WIZO95785 1651 aa39.07■■■■□ 3.85
KRT18P6-201ENST00000555540 CADPSQ9ULU8 1353 aa39■■■■□ 3.83
KRT18P6-201ENST00000555540 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.79■■■■□ 3.8
KRT18P6-201ENST00000555540 WDR62O43379 1518 aa38.71■■■■□ 3.79
KRT18P6-201ENST00000555540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
KRT18P6-201ENST00000555540 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.61■■■■□ 3.77
KRT18P6-201ENST00000555540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
KRT18P6-201ENST00000555540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.56■■■■□ 3.76
KRT18P6-201ENST00000555540 CFTRP13569 1480 aa38.55■■■■□ 3.76
KRT18P6-201ENST00000555540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
KRT18P6-201ENST00000555540 PRDM2Q13029 1718 aa38.22■■■■□ 3.71
KRT18P6-201ENST00000555540 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.12■■■■□ 3.69
KRT18P6-201ENST00000555540 TRIM41Q8WV44 630 aa38.07■■■■□ 3.68
KRT18P6-201ENST00000555540 OSCARQ8IYS5 282 aa37.96■■■■□ 3.67
KRT18P6-201ENST00000555540 IFT140Q96RY7 1462 aa37.85■■■■□ 3.65
KRT18P6-201ENST00000555540 TOPBP1Q92547 1522 aa37.83■■■■□ 3.65
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
KRT18P6-201ENST00000555540 ABCC8Q09428 1581 aa37.76■■■■□ 3.63
KRT18P6-201ENST00000555540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.7■■■■□ 3.63
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
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KRT18P6-201ENST00000555540 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.52■■■■□ 3.6
KRT18P6-201ENST00000555540 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
KRT18P6-201ENST00000555540 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.52■■■■□ 3.6
KRT18P6-201ENST00000555540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.44■■■■□ 3.58
KRT18P6-201ENST00000555540 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
KRT18P6-201ENST00000555540 ARHGEF11O15085 1522 aa37.38■■■■□ 3.57
KRT18P6-201ENST00000555540 CHD1O14646 1710 aa37.35■■■■□ 3.57
KRT18P6-201ENST00000555540 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.29■■■■□ 3.56
KRT18P6-201ENST00000555540 SOGA1O94964 1423 aa37.25■■■■□ 3.55
KRT18P6-201ENST00000555540 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.19■■■■□ 3.54
KRT18P6-201ENST00000555540 FBLN2P98095 1184 aa37.18■■■■□ 3.54
KRT18P6-201ENST00000555540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
KRT18P6-201ENST00000555540 CUX1P39880 1505 aa37.15■■■■□ 3.54
KRT18P6-201ENST00000555540 WDR97A6NE52 1622 aa37.15■■■■□ 3.54
KRT18P6-201ENST00000555540 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.07■■■■□ 3.52
KRT18P6-201ENST00000555540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.06■■■■□ 3.52
KRT18P6-201ENST00000555540 ARAP1Q96P48 1450 aa37.01■■■■□ 3.51
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KRT18P6-201ENST00000555540 GRIN2BQ13224 1484 aa36.95■■■■□ 3.51
KRT18P6-201ENST00000555540 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.91■■■■□ 3.5
KRT18P6-201ENST00000555540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
KRT18P6-201ENST00000555540 SYNJ1O43426 1573 aa36.88■■■■□ 3.49
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KRT18P6-201ENST00000555540 PBRM1Q86U86 1689 aa36.84■■■■□ 3.49
KRT18P6-201ENST00000555540 SYNJ2O15056 1496 aa36.84■■■■□ 3.49
KRT18P6-201ENST00000555540 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.82■■■■□ 3.48
KRT18P6-201ENST00000555540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.78■■■■□ 3.48
KRT18P6-201ENST00000555540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.74■■■■□ 3.47
KRT18P6-201ENST00000555540 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
KRT18P6-201ENST00000555540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
KRT18P6-201ENST00000555540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.57■■■■□ 3.44
KRT18P6-201ENST00000555540 TOP2BQ02880 1626 aa36.56■■■■□ 3.44
KRT18P6-201ENST00000555540 GRIN2AQ12879 1464 aa36.48■■■■□ 3.43
KRT18P6-201ENST00000555540 ADAMTS12P58397 1594 aa36.46■■■■□ 3.43
KRT18P6-201ENST00000555540 CEP170Q5SW79 1584 aa36.36■■■■□ 3.41
KRT18P6-201ENST00000555540 NUP160Q12769 1436 aa36.36■■■■□ 3.41
KRT18P6-201ENST00000555540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.34■■■■□ 3.41
KRT18P6-201ENST00000555540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.32■■■■□ 3.4
KRT18P6-201ENST00000555540 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.32■■■■□ 3.4
KRT18P6-201ENST00000555540 SHROOM2Q13796 1616 aa36.23■■■■□ 3.39
KRT18P6-201ENST00000555540 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
KRT18P6-201ENST00000555540 JPH4Q96JJ6 628 aa35.97■■■■□ 3.35
KRT18P6-201ENST00000555540 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.96■■■■□ 3.35
KRT18P6-201ENST00000555540 IGF1RP08069 1367 aa35.81■■■■□ 3.32
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