RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555360.1

ZBTB42-202, Transcript of zinc finger and BTB domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBTB42, Length 1,411 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB42-202ENST00000555360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.71■■■■■ 5.71
ZBTB42-202ENST00000555360 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.6■■■■■ 4.89
ZBTB42-202ENST00000555360 ABCC9O60706 1549 aa45.38■■■■■ 4.86
ZBTB42-202ENST00000555360 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.32■■■■■ 4.53
ZBTB42-202ENST00000555360 NACADO15069 1562 aa43.03■■■■■ 4.48
ZBTB42-202ENST00000555360 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.71■■■■■ 4.43
ZBTB42-202ENST00000555360 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.46■■■■■ 4.39
ZBTB42-202ENST00000555360 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.44■■■■■ 4.38
ZBTB42-202ENST00000555360 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.43■■■■■ 4.38
ZBTB42-202ENST00000555360 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.2■■■■■ 4.35
ZBTB42-202ENST00000555360 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
ZBTB42-202ENST00000555360 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
ZBTB42-202ENST00000555360 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.94■■■■■ 4.3
ZBTB42-202ENST00000555360 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.51■■■■■ 4.24
ZBTB42-202ENST00000555360 SCRIBQ14160 1630 aa41.46■■■■■ 4.23
ZBTB42-202ENST00000555360 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.07■■■■■ 4.16
ZBTB42-202ENST00000555360 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
ZBTB42-202ENST00000555360 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.89■■■■■ 4.14
ZBTB42-202ENST00000555360 NCAPD3P42695 1498 aa39.67■■■■□ 3.94
ZBTB42-202ENST00000555360 SMARCA4P51532 1647 aa39.59■■■■□ 3.93
ZBTB42-202ENST00000555360 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.55■■■■□ 3.92
ZBTB42-202ENST00000555360 SMARCA2P51531 1590 aa39.5■■■■□ 3.91
ZBTB42-202ENST00000555360 HMGXB3Q12766 1538 aa39.44■■■■□ 3.9
ZBTB42-202ENST00000555360 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
ZBTB42-202ENST00000555360 ERCC6Q03468 1493 aa39.22■■■■□ 3.87
ZBTB42-202ENST00000555360 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.21■■■■□ 3.87
ZBTB42-202ENST00000555360 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
ZBTB42-202ENST00000555360 CUX2O14529 1486 aa39.15■■■■□ 3.86
ZBTB42-202ENST00000555360 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.05■■■■□ 3.84
ZBTB42-202ENST00000555360 NESP48681 1621 aa39■■■■□ 3.83
ZBTB42-202ENST00000555360 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.97■■■■□ 3.83
ZBTB42-202ENST00000555360 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.84■■■■□ 3.81
ZBTB42-202ENST00000555360 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
ZBTB42-202ENST00000555360 WIZO95785 1651 aa38.64■■■■□ 3.78
ZBTB42-202ENST00000555360 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.62■■■■□ 3.77
ZBTB42-202ENST00000555360 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.55■■■■□ 3.76
ZBTB42-202ENST00000555360 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.46■■■■□ 3.75
ZBTB42-202ENST00000555360 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
ZBTB42-202ENST00000555360 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.22■■■■□ 3.71
ZBTB42-202ENST00000555360 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
ZBTB42-202ENST00000555360 WDR62O43379 1518 aa38.14■■■■□ 3.7
ZBTB42-202ENST00000555360 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.09■■■■□ 3.69
ZBTB42-202ENST00000555360 CFTRP13569 1480 aa38.04■■■■□ 3.68
ZBTB42-202ENST00000555360 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.04■■■■□ 3.68
ZBTB42-202ENST00000555360 PRDM2Q13029 1718 aa37.87■■■■□ 3.65
ZBTB42-202ENST00000555360 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
ZBTB42-202ENST00000555360 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.67■■■■□ 3.62
ZBTB42-202ENST00000555360 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
ZBTB42-202ENST00000555360 OSCARQ8IYS5 282 aa37.33■■■■□ 3.57
ZBTB42-202ENST00000555360 TOPBP1Q92547 1522 aa37.33■■■■□ 3.57
ZBTB42-202ENST00000555360 IFT140Q96RY7 1462 aa37.32■■■■□ 3.56
ZBTB42-202ENST00000555360 ABCC8Q09428 1581 aa37.3■■■■□ 3.56
ZBTB42-202ENST00000555360 TRIM41Q8WV44 630 aa37.28■■■■□ 3.56
ZBTB42-202ENST00000555360 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.24■■■■□ 3.55
ZBTB42-202ENST00000555360 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
ZBTB42-202ENST00000555360 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
ZBTB42-202ENST00000555360 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
ZBTB42-202ENST00000555360 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
ZBTB42-202ENST00000555360 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.89■■■■□ 3.5
ZBTB42-202ENST00000555360 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.89■■■■□ 3.5
ZBTB42-202ENST00000555360 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.89■■■■□ 3.5
ZBTB42-202ENST00000555360 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.5
ZBTB42-202ENST00000555360 CHD1O14646 1710 aa36.86■■■■□ 3.49
ZBTB42-202ENST00000555360 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.78■■■■□ 3.48
ZBTB42-202ENST00000555360 SOGA1O94964 1423 aa36.76■■■■□ 3.48
ZBTB42-202ENST00000555360 ARHGEF11O15085 1522 aa36.74■■■■□ 3.47
ZBTB42-202ENST00000555360 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.72■■■■□ 3.47
ZBTB42-202ENST00000555360 WDR97A6NE52 1622 aa36.72■■■■□ 3.47
ZBTB42-202ENST00000555360 CUX1P39880 1505 aa36.7■■■■□ 3.47
ZBTB42-202ENST00000555360 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
ZBTB42-202ENST00000555360 FBLN2P98095 1184 aa36.62■■■■□ 3.45
ZBTB42-202ENST00000555360 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.54■■■■□ 3.44
ZBTB42-202ENST00000555360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
ZBTB42-202ENST00000555360 GRIN2BQ13224 1484 aa36.46■■■■□ 3.43
ZBTB42-202ENST00000555360 PBRM1Q86U86 1689 aa36.43■■■■□ 3.42
ZBTB42-202ENST00000555360 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.42■■■■□ 3.42
ZBTB42-202ENST00000555360 SYNJ1O43426 1573 aa36.38■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 ARAP1Q96P48 1450 aa36.37■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.36■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 SYNJ2O15056 1496 aa36.34■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.34■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.33■■■■□ 3.41
ZBTB42-202ENST00000555360 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.3■■■■□ 3.4
ZBTB42-202ENST00000555360 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.21■■■■□ 3.39
ZBTB42-202ENST00000555360 TOP2BQ02880 1626 aa36.18■■■■□ 3.38
ZBTB42-202ENST00000555360 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
ZBTB42-202ENST00000555360 ADAMTS12P58397 1594 aa36.01■■■■□ 3.36
ZBTB42-202ENST00000555360 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
ZBTB42-202ENST00000555360 GRIN2AQ12879 1464 aa35.99■■■■□ 3.35
ZBTB42-202ENST00000555360 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.9■■■■□ 3.34
ZBTB42-202ENST00000555360 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.88■■■■□ 3.33
ZBTB42-202ENST00000555360 CEP170Q5SW79 1584 aa35.87■■■■□ 3.33
ZBTB42-202ENST00000555360 NUP160Q12769 1436 aa35.86■■■■□ 3.33
ZBTB42-202ENST00000555360 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.76■■■■□ 3.32
ZBTB42-202ENST00000555360 SHROOM2Q13796 1616 aa35.75■■■■□ 3.31
ZBTB42-202ENST00000555360 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.51■■■■□ 3.28
ZBTB42-202ENST00000555360 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
ZBTB42-202ENST00000555360 JPH4Q96JJ6 628 aa35.47■■■■□ 3.27
ZBTB42-202ENST00000555360 CUL7Q14999 1698 aa35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms