RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.65■■■□□ 2.66
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SOGA3-203ENST00000525778 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.64■■■□□ 2.34
SOGA3-203ENST00000525778 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.53■■■□□ 2.32
SOGA3-203ENST00000525778 HRCP23327 699 aa29.39■■■□□ 2.3
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SOGA3-203ENST00000525778 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
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SOGA3-203ENST00000525778 BCANQ96GW7 911 aa26.32■■□□□ 1.8
SOGA3-203ENST00000525778 MIER1Q8N108 512 aa26.3■■□□□ 1.8
SOGA3-203ENST00000525778 ITGAEP38570 1179 aa26.08■■□□□ 1.77
SOGA3-203ENST00000525778 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.94■■□□□ 1.74
SOGA3-203ENST00000525778 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.9■■□□□ 1.74
SOGA3-203ENST00000525778 FKBP8Q14318 412 aa25.83■■□□□ 1.73
SOGA3-203ENST00000525778 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
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SOGA3-203ENST00000525778 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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SOGA3-203ENST00000525778 ANP32CO43423 234 aa25.53■■□□□ 1.68
SOGA3-203ENST00000525778 SCRIBQ14160 1630 aa25.51■■□□□ 1.67
SOGA3-203ENST00000525778 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.5■■□□□ 1.67
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SOGA3-203ENST00000525778 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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SOGA3-203ENST00000525778 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SOGA3-203ENST00000525778 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.19■■□□□ 1.62
SOGA3-203ENST00000525778 CLIP1P30622 1438 aa25.17■■□□□ 1.62
SOGA3-203ENST00000525778 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SOGA3-203ENST00000525778 NBR1Q14596 966 aa25.17■■□□□ 1.62
SOGA3-203ENST00000525778 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.1■■□□□ 1.61
SOGA3-203ENST00000525778 GOLGA3Q08378 1498 aa25.06■■□□□ 1.6
SOGA3-203ENST00000525778 SOGA1O94964 1423 aa25.05■■□□□ 1.6
SOGA3-203ENST00000525778 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SOGA3-203ENST00000525778 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SOGA3-203ENST00000525778 KCNH8Q96L42 1107 aa25.01■■□□□ 1.59
SOGA3-203ENST00000525778 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.01■■□□□ 1.59
SOGA3-203ENST00000525778 EEA1Q15075 1411 aa25■■□□□ 1.59
SOGA3-203ENST00000525778 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
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SOGA3-203ENST00000525778 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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SOGA3-203ENST00000525778 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.83■■□□□ 1.57
SOGA3-203ENST00000525778 ABCC8Q09428 1581 aa24.81■■□□□ 1.56
SOGA3-203ENST00000525778 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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SOGA3-203ENST00000525778 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.76■■□□□ 1.55
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.74■■□□□ 1.55
SOGA3-203ENST00000525778 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.72■■□□□ 1.55
SOGA3-203ENST00000525778 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.69■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 MRS2Q9HD23 443 aa24.68■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.68■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SOGA3-203ENST00000525778 CCER2I3L3R5 266 aa24.65■■□□□ 1.54
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