Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.066e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 321.03■□□□□ 0.966e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.876e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.856e-9■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.78e-7■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 TRAF2-203ENST00000419057 709 ntTSL 321.61■■□□□ 1.058e-7■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 TRAF2-204ENST00000429509 823 ntTSL 321.47■■□□□ 1.038e-7■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 218.52■□□□□ 0.566e-7■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 MATR3-225ENST00000514528 532 ntTSL 427.17■■□□□ 1.948e-25■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 212.15□□□□□ -0.468e-25■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 229.71■■■□□ 2.353e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 527.71■■■□□ 2.032e-12■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 423.97■■□□□ 1.432e-12■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 223.69■■□□□ 1.382e-12■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 218.59■□□□□ 0.574e-8■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 FAM20B-202ENST00000440702 603 ntTSL 327.04■■□□□ 1.924e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.284e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 523.26■■□□□ 1.312e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 322.23■■□□□ 1.152e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 522.17■■□□□ 1.142e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.962e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 520.42■□□□□ 0.862e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 520.03■□□□□ 0.82e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.332e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 514.03□□□□□ -0.162e-10■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-203ENST00000460198 533 ntTSL 328.73■■■□□ 2.191e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 525.58■■□□□ 1.692e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 425.07■■□□□ 1.62e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 423.61■■□□□ 1.372e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 420.87■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 16.6
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DROSHAQ9NRR4 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 520.5■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 420.35■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 519.83■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 16.6
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DROSHAQ9NRR4 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 413.88□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 16.6
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 329.49■■■□□ 2.312e-6■■■□□ 16.5
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DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-207ENST00000451179 1196 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-215ENST00000616073 512 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■□□ 16.5
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DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.232e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PAX8-AS1-220ENST00000624706 434 ntTSL 55.92□□□□□ -1.462e-7■■■□□ 16.5
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DROSHAQ9NRR4 DDX5-228ENST00000584279 676 ntTSL 332.98■■■□□ 2.878e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.777e-7■■■□□ 16.5
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DROSHAQ9NRR4 TCF25-213ENST00000564957 459 ntTSL 328.54■■■□□ 2.162e-9■■■□□ 16.5
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DROSHAQ9NRR4 DDX5-231ENST00000585060 572 ntTSL 414.22□□□□□ -0.138e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 211.05□□□□□ -0.648e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.486e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf204-202ENST00000431158 2954 ntTSL 1 (best)23.1■■□□□ 1.296e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 C20orf204-203ENST00000444463 4303 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.786e-7■■■□□ 16.5
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DROSHAQ9NRR4 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 520.14■□□□□ 0.817e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.84■■■■■ 4.139e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-217ENST00000550795 513 ntTSL 337.53■■■■□ 3.69e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 CPSF1-202ENST00000527827 619 ntTSL 237.42■■■■□ 3.589e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.559e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.449e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.439e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 ATP8B2-204ENST00000426445 2118 ntTSL 535.92■■■■□ 3.349e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-206ENST00000602479 752 ntTSL 333.88■■■■□ 3.019e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-207ENST00000602499 744 ntTSL 233.7■■■□□ 2.989e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.969e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 PXN-220ENST00000637386 621 ntTSL 532.37■■■□□ 2.779e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.659e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.639e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MED10-203ENST00000504058 648 ntTSL 229.77■■■□□ 2.369e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.259e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.239e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 NAPA-215ENST00000597271 1467 ntTSL 228.82■■■□□ 2.29e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MAP1LC3B-206ENST00000564844 3085 ntTSL 1 (best)27.78■■■□□ 2.042e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.932e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 MAP1LC3B-208ENST00000570189 1259 ntTSL 1 (best)26.42■■□□□ 1.822e-9■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-203ENST00000411971 783 ntTSL 526■■□□□ 1.759e-7■■■□□ 16.5
DROSHAQ9NRR4 SCAMP4-211ENST00000588907 547 ntTSL 425.95■■□□□ 1.759e-7■■■□□ 16.5
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