RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588907.2

SCAMP4-211, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SCAMP4, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-211ENST00000588907 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.01■■■■■ 4
SCAMP4-211ENST00000588907 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.39■■■■□ 3.26
SCAMP4-211ENST00000588907 ABCC9O60706 1549 aa33.84■■■■□ 3.01
SCAMP4-211ENST00000588907 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
SCAMP4-211ENST00000588907 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.23■■■□□ 2.91
SCAMP4-211ENST00000588907 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.17■■■□□ 2.9
SCAMP4-211ENST00000588907 NACADO15069 1562 aa33.11■■■□□ 2.89
SCAMP4-211ENST00000588907 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.04■■■□□ 2.88
SCAMP4-211ENST00000588907 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.98■■■□□ 2.87
SCAMP4-211ENST00000588907 SCRIBQ14160 1630 aa32.21■■■□□ 2.75
SCAMP4-211ENST00000588907 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.14■■■□□ 2.74
SCAMP4-211ENST00000588907 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.85■■■□□ 2.69
SCAMP4-211ENST00000588907 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.83■■■□□ 2.69
SCAMP4-211ENST00000588907 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.68■■■□□ 2.66
SCAMP4-211ENST00000588907 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
SCAMP4-211ENST00000588907 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
SCAMP4-211ENST00000588907 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.99■■■□□ 2.55
SCAMP4-211ENST00000588907 SMARCA4P51532 1647 aa30.92■■■□□ 2.54
SCAMP4-211ENST00000588907 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.78■■■□□ 2.52
SCAMP4-211ENST00000588907 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.7■■■□□ 2.51
SCAMP4-211ENST00000588907 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
SCAMP4-211ENST00000588907 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.66■■■□□ 2.5
SCAMP4-211ENST00000588907 SMARCA2P51531 1590 aa30.66■■■□□ 2.5
SCAMP4-211ENST00000588907 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.57■■■□□ 2.48
SCAMP4-211ENST00000588907 NCAPD3P42695 1498 aa30.5■■■□□ 2.47
SCAMP4-211ENST00000588907 WIZO95785 1651 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-211ENST00000588907 HMGXB3Q12766 1538 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-211ENST00000588907 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-211ENST00000588907 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.37■■■□□ 2.45
SCAMP4-211ENST00000588907 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
SCAMP4-211ENST00000588907 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
SCAMP4-211ENST00000588907 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.86■■■□□ 2.37
SCAMP4-211ENST00000588907 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.64■■■□□ 2.33
SCAMP4-211ENST00000588907 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.63■■■□□ 2.33
SCAMP4-211ENST00000588907 CFTRP13569 1480 aa29.6■■■□□ 2.33
SCAMP4-211ENST00000588907 PRDM2Q13029 1718 aa29.48■■■□□ 2.31
SCAMP4-211ENST00000588907 NESP48681 1621 aa29.45■■■□□ 2.3
SCAMP4-211ENST00000588907 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-211ENST00000588907 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-211ENST00000588907 ERCC6Q03468 1493 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-211ENST00000588907 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-211ENST00000588907 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.18■■■□□ 2.26
SCAMP4-211ENST00000588907 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.04■■■□□ 2.24
SCAMP4-211ENST00000588907 ABCC8Q09428 1581 aa29.02■■■□□ 2.24
SCAMP4-211ENST00000588907 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
SCAMP4-211ENST00000588907 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
SCAMP4-211ENST00000588907 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.94■■■□□ 2.22
SCAMP4-211ENST00000588907 WDR62O43379 1518 aa28.93■■■□□ 2.22
SCAMP4-211ENST00000588907 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SCAMP4-211ENST00000588907 TOPBP1Q92547 1522 aa28.87■■■□□ 2.21
SCAMP4-211ENST00000588907 CUX1P39880 1505 aa28.86■■■□□ 2.21
SCAMP4-211ENST00000588907 TOP2BQ02880 1626 aa28.84■■■□□ 2.21
SCAMP4-211ENST00000588907 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.83■■■□□ 2.21
SCAMP4-211ENST00000588907 SYNJ1O43426 1573 aa28.8■■■□□ 2.2
SCAMP4-211ENST00000588907 CUX2O14529 1486 aa28.73■■■□□ 2.19
SCAMP4-211ENST00000588907 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-211ENST00000588907 TRIM41Q8WV44 630 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-211ENST00000588907 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-211ENST00000588907 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-211ENST00000588907 IFT140Q96RY7 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
SCAMP4-211ENST00000588907 SOGA1O94964 1423 aa28.56■■■□□ 2.16
SCAMP4-211ENST00000588907 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SCAMP4-211ENST00000588907 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.48■■■□□ 2.15
SCAMP4-211ENST00000588907 WDR97A6NE52 1622 aa28.47■■■□□ 2.15
SCAMP4-211ENST00000588907 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.46■■■□□ 2.15
SCAMP4-211ENST00000588907 KIF27Q86VH2 1401 aa28.34■■■□□ 2.13
SCAMP4-211ENST00000588907 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-211ENST00000588907 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-211ENST00000588907 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-211ENST00000588907 EEA1Q15075 1411 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-211ENST00000588907 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-211ENST00000588907 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SCAMP4-211ENST00000588907 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.116e-12■■■■■ 56.8
SCAMP4-211ENST00000588907 GRIN2BQ13224 1484 aa28.2■■■□□ 2.1
SCAMP4-211ENST00000588907 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.19■■■□□ 2.1
SCAMP4-211ENST00000588907 PBRM1Q86U86 1689 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-211ENST00000588907 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SCAMP4-211ENST00000588907 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.09■■■□□ 2.09
SCAMP4-211ENST00000588907 CUL7Q14999 1698 aa28.08■■■□□ 2.09
SCAMP4-211ENST00000588907 IGF1RP08069 1367 aa28.06■■■□□ 2.08
SCAMP4-211ENST00000588907 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.02■■■□□ 2.08
SCAMP4-211ENST00000588907 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.01■■■□□ 2.07
SCAMP4-211ENST00000588907 ADAMTS12P58397 1594 aa27.99■■■□□ 2.07
SCAMP4-211ENST00000588907 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.98■■■□□ 2.07
SCAMP4-211ENST00000588907 SYNJ2O15056 1496 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-211ENST00000588907 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-211ENST00000588907 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-211ENST00000588907 PRXQ9BXM0 1461 aa27.91■■■□□ 2.06
SCAMP4-211ENST00000588907 KIF21BO75037 1637 aa27.89■■■□□ 2.05
SCAMP4-211ENST00000588907 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-211ENST00000588907 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SCAMP4-211ENST00000588907 GRIN2AQ12879 1464 aa27.82■■■□□ 2.04
SCAMP4-211ENST00000588907 CHD1O14646 1710 aa27.78■■■□□ 2.04
SCAMP4-211ENST00000588907 GOLGA3Q08378 1498 aa27.76■■■□□ 2.03
SCAMP4-211ENST00000588907 FBLN2P98095 1184 aa27.75■■■□□ 2.03
SCAMP4-211ENST00000588907 NUP160Q12769 1436 aa27.67■■■□□ 2.02
SCAMP4-211ENST00000588907 CEP170Q5SW79 1584 aa27.61■■■□□ 2.01
SCAMP4-211ENST00000588907 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.6■■■□□ 2.01
SCAMP4-211ENST00000588907 OSCARQ8IYS5 282 aa27.58■■■□□ 2.01
SCAMP4-211ENST00000588907 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.57■■■□□ 2
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