Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 220.32■□□□□ 0.841e-7■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 KHSRP-212ENST00000600480 851 ntTSL 217.57■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-7■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SLC17A9-204ENST00000459704 2015 ntTSL 317.63■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 212.94□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.363e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.463e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CELF1-213ENST00000530151 583 ntTSL 324.17■■□□□ 1.463e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.115e-6■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 TNKS1BP1-202ENST00000427750 1946 ntTSL 221.93■■□□□ 1.13e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SSU72-204ENST00000378726 2238 ntTSL 220.69■□□□□ 0.93e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CELF1-210ENST00000526419 476 ntTSL 420.53■□□□□ 0.883e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.753e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CELF1-208ENST00000525841 622 ntTSL 516.38■□□□□ 0.213e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.163e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.123e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.098e-7■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 TNKS1BP1-206ENST00000532273 592 ntTSL 215.28■□□□□ 0.043e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -05e-6■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.083e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.263e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.363e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.63□□□□□ -0.393e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 MIR647-201ENST00000384823 96 ntBASIC11.92□□□□□ -0.53e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 311.52□□□□□ -0.572e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 411.36□□□□□ -0.592e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CCNB2-204ENST00000561077 687 ntTSL 511.1□□□□□ -0.633e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 48.81□□□□□ -12e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.033e-9■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.122e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 56.96□□□□□ -1.32e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.352e-16■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.063e-12■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-214ENST00000461469 560 ntTSL 326.11■■□□□ 1.779e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-211ENST00000444719 762 ntTSL 324.69■■□□□ 1.549e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-205ENST00000430278 523 ntTSL 422.99■■□□□ 1.279e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 522.99■■□□□ 1.279e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-208ENST00000434278 678 ntTSL 522.42■■□□□ 1.189e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 219.05■□□□□ 0.649e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.229e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.319e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.259e-8■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 515.44■□□□□ 0.062e-7■■■□□ 16.4
PCBP1Q15365 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 224.68■■□□□ 1.542e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 319.39■□□□□ 0.692e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EMD-206ENST00000485261 792 ntTSL 319.31■□□□□ 0.682e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 319.05■□□□□ 0.642e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 218.84■□□□□ 0.612e-19■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.171e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.761e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 520.41■□□□□ 0.863e-10■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 514.6□□□□□ -0.073e-10■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 CCNI-206ENST00000511943 576 ntTSL 35.3□□□□□ -1.563e-10■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.722e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.472e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-213ENST00000481030 790 ntTSL 312.72□□□□□ -0.372e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-13■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 DROSHA-207ENST00000507438 860 ntTSL 411.1□□□□□ -0.639e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.779e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.959e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.429e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-205ENST00000534885 2069 ntTSL 1 (best)21.97■■□□□ 1.112e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.92e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-209ENST00000536717 1503 ntTSL 219.81■□□□□ 0.762e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-216ENST00000543995 1531 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-215ENST00000543359 627 ntTSL 314.58□□□□□ -0.082e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TNFRSF1A-210ENST00000537842 404 ntTSL 32.92□□□□□ -1.942e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.414e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 517.18■□□□□ 0.344e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 215.63■□□□□ 0.094e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.064e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.498e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 INSIG1-204ENST00000425172 596 ntTSL 226.61■■□□□ 1.856e-7■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 16.3
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