Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPXQ9UHP9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms