RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299572.9

CENPN-201, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPN, Length 1,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-201ENST00000299572 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.79■■■■■ 5.72
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CENPN-201ENST00000299572 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
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CENPN-201ENST00000299572 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.5■■■■□ 3.75
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CENPN-201ENST00000299572 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.07■■■■□ 3.68
CENPN-201ENST00000299572 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.03■■■■□ 3.68
CENPN-201ENST00000299572 PRDM2Q13029 1718 aa37.78■■■■□ 3.64
CENPN-201ENST00000299572 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.74■■■■□ 3.63
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CENPN-201ENST00000299572 TOPBP1Q92547 1522 aa37.34■■■■□ 3.57
CENPN-201ENST00000299572 IFT140Q96RY7 1462 aa37.29■■■■□ 3.56
CENPN-201ENST00000299572 ABCC8Q09428 1581 aa37.28■■■■□ 3.56
CENPN-201ENST00000299572 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.23■■■■□ 3.55
CENPN-201ENST00000299572 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
CENPN-201ENST00000299572 OSCARQ8IYS5 282 aa37.17■■■■□ 3.54
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CENPN-201ENST00000299572 TRIM41Q8WV44 630 aa37.04■■■■□ 3.52
CENPN-201ENST00000299572 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
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CENPN-201ENST00000299572 SOGA1O94964 1423 aa36.77■■■■□ 3.48
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CENPN-201ENST00000299572 CHD1O14646 1710 aa36.74■■■■□ 3.47
CENPN-201ENST00000299572 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPN-201ENST00000299572 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPN-201ENST00000299572 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPN-201ENST00000299572 WDR97A6NE52 1622 aa36.67■■■■□ 3.46
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CENPN-201ENST00000299572 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.3■■■■□ 3.4
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CENPN-201ENST00000299572 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.27■■■■□ 3.4
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CENPN-201ENST00000299572 SHROOM2Q13796 1616 aa35.7■■■■□ 3.31
CENPN-201ENST00000299572 KIF27Q86VH2 1401 aa35.53■■■■□ 3.28
CENPN-201ENST00000299572 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.51■■■■□ 3.28
CENPN-201ENST00000299572 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
CENPN-201ENST00000299572 CUL7Q14999 1698 aa35.47■■■■□ 3.27
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