Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP4-204ENST00000404424 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDK4-201ENST00000005178 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL3-203ENST00000367772 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA10-204ENST00000554723 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO8-201ENST00000393674 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SVILP1-201ENST00000422642 2676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM71A-201ENST00000294829 2305 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01018-201ENST00000505626 3036 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms