Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 224.41■■□□□ 1.58e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.468e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 PLA2G6-221ENST00000471636 569 ntTSL 422.16■■□□□ 1.148e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 18e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.848e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.848e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 320.16■□□□□ 0.828e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 520.16■□□□□ 0.828e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.818e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 TFCP2-203ENST00000548108 1508 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.648e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 EP400-209ENST00000616136 3134 ntTSL 218.02■□□□□ 0.488e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.448e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 PLA2G6-224ENST00000490473 601 ntTSL 417.73■□□□□ 0.438e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB2-206ENST00000464566 726 ntTSL 317.53■□□□□ 0.48e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.258e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.228e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.098e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.088e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.028e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 EP400-201ENST00000330386 3908 ntTSL 214.81□□□□□ -0.048e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 EP400-207ENST00000611739 4314 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.328e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.638e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.738e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.748e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.768e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 310.14□□□□□ -0.798e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 HMGB1-207ENST00000468384 503 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.878e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.978e-9■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-6■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 17.4
DROSHAQ9NRR4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.053e-8■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 327.71■■■□□ 2.033e-8■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 245.24■■■■■ 4.831e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-209ENST00000565511 783 ntTSL 337.15■■■■□ 3.541e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.441e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.391e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 235.94■■■■□ 3.341e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.751e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 325.43■■□□□ 1.661e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.551e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.245e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.278e-14■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.868e-14■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.688e-14■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.58e-14■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 36.12□□□□□ -1.438e-14■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 222.18■■□□□ 1.142e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.721e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.651e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.461e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 533.07■■■□□ 2.885e-13■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 224.69■■□□□ 1.545e-13■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 520.04■□□□□ 0.85e-13■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 513.47□□□□□ -0.255e-13■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.915e-13■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.215e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.485e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.032e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 CCDC144NL-202ENST00000539177 443 ntTSL 323.66■■□□□ 1.389e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.399e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 CCDC144NL-203ENST00000539484 751 ntTSL 314.17□□□□□ -0.149e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 222.78■■□□□ 1.243e-40■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-213ENST00000575667 1644 ntTSL 1 (best)36.29■■■■□ 3.42e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-206ENST00000571418 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 233.78■■■■□ 32e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-211ENST00000572819 1345 ntTSL 533.02■■■□□ 2.882e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.792e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.292e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-215ENST00000576129 991 ntTSL 229.05■■■□□ 2.242e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-204ENST00000570833 558 ntTSL 519.66■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 DPH1-216ENST00000576891 537 ntTSL 416.97■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 232.55■■■□□ 2.84e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 213.63□□□□□ -0.233e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 243.34■■■■■ 4.532e-7■■■□□ 17.3
DROSHAQ9NRR4 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 534.38■■■■□ 3.091e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.591e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-219ENST00000532127 604 ntTSL 229.87■■■□□ 2.371e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.271e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 328.87■■■□□ 2.211e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.791e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-207ENST00000526459 1003 ntTSL 223.42■■□□□ 1.341e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.331e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-221ENST00000533162 761 ntTSL 322.71■■□□□ 1.231e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-206ENST00000526151 557 ntTSL 322.52■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-215ENST00000529999 867 ntTSL 322.02■■□□□ 1.121e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-211ENST00000527744 1007 ntTSL 221.05■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 220.44■□□□□ 0.867e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 232.32■■■□□ 2.773e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.783e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-7■■■□□ 17.2
DROSHAQ9NRR4 AGAP3-219ENST00000485904 683 ntTSL 330.71■■■□□ 2.512e-6■■■□□ 17.2
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