Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKIRAS1Q9NYS0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms