RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.42■■■■■ 5.02
ODC1-202ENST00000405333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.56■■■■■ 4.08
ODC1-202ENST00000405333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
ODC1-202ENST00000405333 ABCC9O60706 1549 aa38.77■■■■□ 3.8
ODC1-202ENST00000405333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.54■■■■□ 3.76
ODC1-202ENST00000405333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.28■■■■□ 3.72
ODC1-202ENST00000405333 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.92■■■■□ 3.66
ODC1-202ENST00000405333 NACADO15069 1562 aa37.84■■■■□ 3.65
ODC1-202ENST00000405333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.82■■■■□ 3.64
ODC1-202ENST00000405333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.61■■■■□ 3.61
ODC1-202ENST00000405333 SCRIBQ14160 1630 aa37.4■■■■□ 3.58
ODC1-202ENST00000405333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.99■■■■□ 3.51
ODC1-202ENST00000405333 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.58■■■■□ 3.45
ODC1-202ENST00000405333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
ODC1-202ENST00000405333 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.19■■■■□ 3.38
ODC1-202ENST00000405333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
ODC1-202ENST00000405333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
ODC1-202ENST00000405333 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.92■■■■□ 3.34
ODC1-202ENST00000405333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
ODC1-202ENST00000405333 SMARCA4P51532 1647 aa35.77■■■■□ 3.32
ODC1-202ENST00000405333 WIZO95785 1651 aa35.63■■■■□ 3.3
ODC1-202ENST00000405333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
ODC1-202ENST00000405333 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.29■■■■□ 3.24
ODC1-202ENST00000405333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.25■■■■□ 3.23
ODC1-202ENST00000405333 SMARCA2P51531 1590 aa35.16■■■■□ 3.22
ODC1-202ENST00000405333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
ODC1-202ENST00000405333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.06■■■■□ 3.2
ODC1-202ENST00000405333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
ODC1-202ENST00000405333 NCAPD3P42695 1498 aa34.95■■■■□ 3.19
ODC1-202ENST00000405333 HMGXB3Q12766 1538 aa34.87■■■■□ 3.17
ODC1-202ENST00000405333 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.55■■■■□ 3.12
ODC1-202ENST00000405333 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.42■■■■□ 3.1
ODC1-202ENST00000405333 CFTRP13569 1480 aa34.12■■■■□ 3.05
ODC1-202ENST00000405333 ABCC8Q09428 1581 aa34.08■■■■□ 3.05
ODC1-202ENST00000405333 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.05■■■■□ 3.04
ODC1-202ENST00000405333 NESP48681 1621 aa33.98■■■■□ 3.03
ODC1-202ENST00000405333 TRIM41Q8WV44 630 aa33.96■■■■□ 3.03
ODC1-202ENST00000405333 PRDM2Q13029 1718 aa33.93■■■■□ 3.02
ODC1-202ENST00000405333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.81■■■■□ 3
ODC1-202ENST00000405333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
ODC1-202ENST00000405333 SYNJ1O43426 1573 aa33.74■■■□□ 2.99
ODC1-202ENST00000405333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.71■■■□□ 2.99
ODC1-202ENST00000405333 CUX1P39880 1505 aa33.6■■■□□ 2.97
ODC1-202ENST00000405333 TOP2BQ02880 1626 aa33.56■■■□□ 2.96
ODC1-202ENST00000405333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.54■■■□□ 2.96
ODC1-202ENST00000405333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.54■■■□□ 2.96
ODC1-202ENST00000405333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.52■■■□□ 2.96
ODC1-202ENST00000405333 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.5■■■□□ 2.95
ODC1-202ENST00000405333 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
ODC1-202ENST00000405333 SOGA1O94964 1423 aa33.36■■■□□ 2.93
ODC1-202ENST00000405333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
ODC1-202ENST00000405333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.32■■■□□ 2.92
ODC1-202ENST00000405333 TOPBP1Q92547 1522 aa33.31■■■□□ 2.92
ODC1-202ENST00000405333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.29■■■□□ 2.92
ODC1-202ENST00000405333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.26■■■□□ 2.91
ODC1-202ENST00000405333 ERCC6Q03468 1493 aa33.21■■■□□ 2.91
ODC1-202ENST00000405333 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-202ENST00000405333 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.16■■■□□ 2.9
ODC1-202ENST00000405333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
ODC1-202ENST00000405333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.08■■■□□ 2.89
ODC1-202ENST00000405333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.07■■■□□ 2.88
ODC1-202ENST00000405333 EEA1Q15075 1411 aa33.03■■■□□ 2.88
ODC1-202ENST00000405333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
ODC1-202ENST00000405333 WDR62O43379 1518 aa33.02■■■□□ 2.88
ODC1-202ENST00000405333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.99■■■□□ 2.87
ODC1-202ENST00000405333 CUX2O14529 1486 aa32.98■■■□□ 2.87
ODC1-202ENST00000405333 KIF27Q86VH2 1401 aa32.93■■■□□ 2.86
ODC1-202ENST00000405333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.9■■■□□ 2.86
ODC1-202ENST00000405333 WDR97A6NE52 1622 aa32.88■■■□□ 2.85
ODC1-202ENST00000405333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
ODC1-202ENST00000405333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
ODC1-202ENST00000405333 IGF1RP08069 1367 aa32.73■■■□□ 2.83
ODC1-202ENST00000405333 KIF21BO75037 1637 aa32.71■■■□□ 2.83
ODC1-202ENST00000405333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.7■■■□□ 2.83
ODC1-202ENST00000405333 IFT140Q96RY7 1462 aa32.69■■■□□ 2.82
ODC1-202ENST00000405333 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.67■■■□□ 2.82
ODC1-202ENST00000405333 PRXQ9BXM0 1461 aa32.67■■■□□ 2.82
ODC1-202ENST00000405333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA3Q08378 1498 aa32.65■■■□□ 2.82
ODC1-202ENST00000405333 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.63■■■□□ 2.81
ODC1-202ENST00000405333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.62■■■□□ 2.812e-7■■■■□ 22
ODC1-202ENST00000405333 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.81
ODC1-202ENST00000405333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.53■■■□□ 2.8
ODC1-202ENST00000405333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.53■■■□□ 2.8
ODC1-202ENST00000405333 PBRM1Q86U86 1689 aa32.51■■■□□ 2.79
ODC1-202ENST00000405333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
ODC1-202ENST00000405333 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.48■■■□□ 2.79
ODC1-202ENST00000405333 CUL7Q14999 1698 aa32.45■■■□□ 2.78
ODC1-202ENST00000405333 GRIN2BQ13224 1484 aa32.39■■■□□ 2.78
ODC1-202ENST00000405333 CEP162Q5TB80 1403 aa32.35■■■□□ 2.77
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS12P58397 1594 aa32.29■■■□□ 2.76
ODC1-202ENST00000405333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.28■■■□□ 2.76
ODC1-202ENST00000405333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
ODC1-202ENST00000405333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.24■■■□□ 2.75
ODC1-202ENST00000405333 CLIP1P30622 1438 aa32.15■■■□□ 2.74
ODC1-202ENST00000405333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
ODC1-202ENST00000405333 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.1■■■□□ 2.73
ODC1-202ENST00000405333 SYNJ2O15056 1496 aa32.05■■■□□ 2.72
ODC1-202ENST00000405333 GRIN2AQ12879 1464 aa32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms