RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523421.5

CHTF8-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CHTF8, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF8-210ENST00000523421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.45■■■■■ 5.83
CHTF8-210ENST00000523421 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.57■■■■■ 4.89
CHTF8-210ENST00000523421 ABCC9O60706 1549 aa44.53■■■■■ 4.72
CHTF8-210ENST00000523421 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.05■■■■■ 4.48
CHTF8-210ENST00000523421 NACADO15069 1562 aa42.89■■■■■ 4.46
CHTF8-210ENST00000523421 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.88■■■■■ 4.45
CHTF8-210ENST00000523421 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
CHTF8-210ENST00000523421 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.7■■■■■ 4.43
CHTF8-210ENST00000523421 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.57■■■■■ 4.41
CHTF8-210ENST00000523421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.77■■■■■ 4.28
CHTF8-210ENST00000523421 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.71■■■■■ 4.27
CHTF8-210ENST00000523421 SCRIBQ14160 1630 aa41.64■■■■■ 4.26
CHTF8-210ENST00000523421 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.54■■■■■ 4.24
CHTF8-210ENST00000523421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.16■■■■■ 4.18
CHTF8-210ENST00000523421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.76■■■■■ 4.12
CHTF8-210ENST00000523421 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
CHTF8-210ENST00000523421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.24■■■■■ 4.03
CHTF8-210ENST00000523421 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.07■■■■■ 4.01
CHTF8-210ENST00000523421 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
CHTF8-210ENST00000523421 SMARCA4P51532 1647 aa39.84■■■■□ 3.97
CHTF8-210ENST00000523421 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.65■■■■□ 3.94
CHTF8-210ENST00000523421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.64■■■■□ 3.94
CHTF8-210ENST00000523421 NCAPD3P42695 1498 aa39.62■■■■□ 3.93
CHTF8-210ENST00000523421 SMARCA2P51531 1590 aa39.59■■■■□ 3.93
CHTF8-210ENST00000523421 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.45■■■■□ 3.91
CHTF8-210ENST00000523421 HMGXB3Q12766 1538 aa39.37■■■■□ 3.89
CHTF8-210ENST00000523421 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
CHTF8-210ENST00000523421 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
CHTF8-210ENST00000523421 WIZO95785 1651 aa39.19■■■■□ 3.86
CHTF8-210ENST00000523421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
CHTF8-210ENST00000523421 NESP48681 1621 aa38.56■■■■□ 3.76
CHTF8-210ENST00000523421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CHTF8-210ENST00000523421 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.49■■■■□ 3.75
CHTF8-210ENST00000523421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.48■■■■□ 3.75
CHTF8-210ENST00000523421 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.4■■■■□ 3.74
CHTF8-210ENST00000523421 ERCC6Q03468 1493 aa38.39■■■■□ 3.74
CHTF8-210ENST00000523421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
CHTF8-210ENST00000523421 CFTRP13569 1480 aa38.27■■■■□ 3.72
CHTF8-210ENST00000523421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.02■■■■□ 3.68
CHTF8-210ENST00000523421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.01■■■■□ 3.68
CHTF8-210ENST00000523421 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.94■■■■□ 3.66
CHTF8-210ENST00000523421 CUX2O14529 1486 aa37.9■■■■□ 3.66
CHTF8-210ENST00000523421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
CHTF8-210ENST00000523421 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.84■■■■□ 3.65
CHTF8-210ENST00000523421 PRDM2Q13029 1718 aa37.81■■■■□ 3.64
CHTF8-210ENST00000523421 WDR62O43379 1518 aa37.68■■■■□ 3.62
CHTF8-210ENST00000523421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
CHTF8-210ENST00000523421 ABCC8Q09428 1581 aa37.46■■■■□ 3.59
CHTF8-210ENST00000523421 TOPBP1Q92547 1522 aa37.41■■■■□ 3.58
CHTF8-210ENST00000523421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.35■■■■□ 3.57
CHTF8-210ENST00000523421 CUX1P39880 1505 aa37.18■■■■□ 3.54
CHTF8-210ENST00000523421 IFT140Q96RY7 1462 aa37.15■■■■□ 3.54
CHTF8-210ENST00000523421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
CHTF8-210ENST00000523421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.06■■■■□ 3.52
CHTF8-210ENST00000523421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.04■■■■□ 3.52
CHTF8-210ENST00000523421 SOGA1O94964 1423 aa37.02■■■■□ 3.52
CHTF8-210ENST00000523421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.95■■■■□ 3.51
CHTF8-210ENST00000523421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.5
CHTF8-210ENST00000523421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CHTF8-210ENST00000523421 TOP2BQ02880 1626 aa36.88■■■■□ 3.5
CHTF8-210ENST00000523421 SYNJ1O43426 1573 aa36.87■■■■□ 3.49
CHTF8-210ENST00000523421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.85■■■■□ 3.49
CHTF8-210ENST00000523421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.48
CHTF8-210ENST00000523421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
CHTF8-210ENST00000523421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CHTF8-210ENST00000523421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.7■■■■□ 3.47
CHTF8-210ENST00000523421 WDR97A6NE52 1622 aa36.67■■■■□ 3.46
CHTF8-210ENST00000523421 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.6■■■■□ 3.45
CHTF8-210ENST00000523421 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.56■■■■□ 3.44
CHTF8-210ENST00000523421 GRIN2BQ13224 1484 aa36.53■■■■□ 3.44
CHTF8-210ENST00000523421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.47■■■■□ 3.43
CHTF8-210ENST00000523421 OSCARQ8IYS5 282 aa36.46■■■■□ 3.43
CHTF8-210ENST00000523421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.43■■■■□ 3.42
CHTF8-210ENST00000523421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CHTF8-210ENST00000523421 FBLN2P98095 1184 aa36.39■■■■□ 3.42
CHTF8-210ENST00000523421 TRIM41Q8WV44 630 aa36.38■■■■□ 3.41
CHTF8-210ENST00000523421 PBRM1Q86U86 1689 aa36.34■■■■□ 3.41
CHTF8-210ENST00000523421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
CHTF8-210ENST00000523421 KIF27Q86VH2 1401 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF8-210ENST00000523421 SYNJ2O15056 1496 aa36.26■■■■□ 3.4
CHTF8-210ENST00000523421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.25■■■■□ 3.39
CHTF8-210ENST00000523421 CHD1O14646 1710 aa36.21■■■■□ 3.39
CHTF8-210ENST00000523421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.16■■■■□ 3.38
CHTF8-210ENST00000523421 IGF1RP08069 1367 aa36.14■■■■□ 3.38
CHTF8-210ENST00000523421 ADAMTS12P58397 1594 aa36.12■■■■□ 3.37
CHTF8-210ENST00000523421 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.04■■■■□ 3.36
CHTF8-210ENST00000523421 GRIN2AQ12879 1464 aa36.04■■■■□ 3.36
CHTF8-210ENST00000523421 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.97■■■■□ 3.35
CHTF8-210ENST00000523421 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.93■■■■□ 3.34
CHTF8-210ENST00000523421 CUL7Q14999 1698 aa35.91■■■■□ 3.34
CHTF8-210ENST00000523421 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.88■■■■□ 3.33
CHTF8-210ENST00000523421 NUP160Q12769 1436 aa35.88■■■■□ 3.33
CHTF8-210ENST00000523421 CEP170Q5SW79 1584 aa35.81■■■■□ 3.32
CHTF8-210ENST00000523421 ARHGEF11O15085 1522 aa35.75■■■■□ 3.31
CHTF8-210ENST00000523421 EEA1Q15075 1411 aa35.71■■■■□ 3.31
CHTF8-210ENST00000523421 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.7■■■■□ 3.31
CHTF8-210ENST00000523421 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.7■■■■□ 3.31
CHTF8-210ENST00000523421 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.7■■■■□ 3.31
CHTF8-210ENST00000523421 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.7■■■■□ 3.31
CHTF8-210ENST00000523421 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.7■■■■□ 3.31
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