Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.975e-9■□□□□ 10
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NIPBLQ6KC79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.415e-6■□□□□ 10
NIPBLQ6KC79 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 10
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NIPBLQ6KC79 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.872e-8■□□□□ 10
NIPBLQ6KC79 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.952e-8■□□□□ 10
NIPBLQ6KC79 CHD2-226ENST00000636881 3545 ntTSL 55.64□□□□□ -1.513e-7■□□□□ 10
NIPBLQ6KC79 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.633e-7■□□□□ 10
NIPBLQ6KC79 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.833e-7■□□□□ 10
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NIPBLQ6KC79 SNHG8-203ENST00000602520 327 ntTSL 27.88□□□□□ -1.151e-23■□□□□ 10
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