RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557902.1

ANKRD9-202, Transcript of ankyrin repeat domain 9, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD9, Length 620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD9-202ENST00000557902 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.96■■■■■ 6.23
ANKRD9-202ENST00000557902 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.88■■■■■ 5.25
ANKRD9-202ENST00000557902 ABCC9O60706 1549 aa47.41■■■■■ 5.18
ANKRD9-202ENST00000557902 NACADO15069 1562 aa45.03■■■■■ 4.8
ANKRD9-202ENST00000557902 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.03■■■■■ 4.8
ANKRD9-202ENST00000557902 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
ANKRD9-202ENST00000557902 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.92■■■■■ 4.78
ANKRD9-202ENST00000557902 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.85■■■■■ 4.77
ANKRD9-202ENST00000557902 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.72■■■■■ 4.75
ANKRD9-202ENST00000557902 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.68■■■■■ 4.74
ANKRD9-202ENST00000557902 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.12■■■■■ 4.65
ANKRD9-202ENST00000557902 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.04■■■■■ 4.64
ANKRD9-202ENST00000557902 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.74■■■■■ 4.59
ANKRD9-202ENST00000557902 SCRIBQ14160 1630 aa43.67■■■■■ 4.58
ANKRD9-202ENST00000557902 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.28■■■■■ 4.52
ANKRD9-202ENST00000557902 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.83■■■■■ 4.45
ANKRD9-202ENST00000557902 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.74■■■■■ 4.43
ANKRD9-202ENST00000557902 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
ANKRD9-202ENST00000557902 SMARCA4P51532 1647 aa41.81■■■■■ 4.28
ANKRD9-202ENST00000557902 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
ANKRD9-202ENST00000557902 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.62■■■■■ 4.25
ANKRD9-202ENST00000557902 NCAPD3P42695 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
ANKRD9-202ENST00000557902 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.59■■■■■ 4.25
ANKRD9-202ENST00000557902 SMARCA2P51531 1590 aa41.52■■■■■ 4.24
ANKRD9-202ENST00000557902 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.46■■■■■ 4.23
ANKRD9-202ENST00000557902 HMGXB3Q12766 1538 aa41.37■■■■■ 4.21
ANKRD9-202ENST00000557902 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.31■■■■■ 4.2
ANKRD9-202ENST00000557902 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
ANKRD9-202ENST00000557902 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
ANKRD9-202ENST00000557902 WIZO95785 1651 aa41.08■■■■■ 4.17
ANKRD9-202ENST00000557902 ERCC6Q03468 1493 aa40.99■■■■■ 4.15
ANKRD9-202ENST00000557902 CUX2O14529 1486 aa40.98■■■■■ 4.15
ANKRD9-202ENST00000557902 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
ANKRD9-202ENST00000557902 NESP48681 1621 aa40.64■■■■■ 4.1
ANKRD9-202ENST00000557902 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.42■■■■■ 4.06
ANKRD9-202ENST00000557902 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.37■■■■■ 4.05
ANKRD9-202ENST00000557902 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
ANKRD9-202ENST00000557902 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.23■■■■■ 4.03
ANKRD9-202ENST00000557902 CFTRP13569 1480 aa40.16■■■■■ 4.02
ANKRD9-202ENST00000557902 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.16■■■■■ 4.02
ANKRD9-202ENST00000557902 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.15■■■■■ 4.02
ANKRD9-202ENST00000557902 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
ANKRD9-202ENST00000557902 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.88■■■■□ 3.97
ANKRD9-202ENST00000557902 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.8■■■■□ 3.96
ANKRD9-202ENST00000557902 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.77■■■■□ 3.96
ANKRD9-202ENST00000557902 PRDM2Q13029 1718 aa39.72■■■■□ 3.95
ANKRD9-202ENST00000557902 WDR62O43379 1518 aa39.67■■■■□ 3.94
ANKRD9-202ENST00000557902 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
ANKRD9-202ENST00000557902 TRIM41Q8WV44 630 aa39.41■■■■□ 3.9
ANKRD9-202ENST00000557902 TOPBP1Q92547 1522 aa39.26■■■■□ 3.88
ANKRD9-202ENST00000557902 ABCC8Q09428 1581 aa39.24■■■■□ 3.87
ANKRD9-202ENST00000557902 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.2■■■■□ 3.87
ANKRD9-202ENST00000557902 OSCARQ8IYS5 282 aa39.13■■■■□ 3.85
ANKRD9-202ENST00000557902 CUX1P39880 1505 aa39■■■■□ 3.83
ANKRD9-202ENST00000557902 IFT140Q96RY7 1462 aa38.98■■■■□ 3.83
ANKRD9-202ENST00000557902 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
ANKRD9-202ENST00000557902 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.84■■■■□ 3.81
ANKRD9-202ENST00000557902 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
ANKRD9-202ENST00000557902 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
ANKRD9-202ENST00000557902 SOGA1O94964 1423 aa38.76■■■■□ 3.8
ANKRD9-202ENST00000557902 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.76■■■■□ 3.8
ANKRD9-202ENST00000557902 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.76■■■■□ 3.8
ANKRD9-202ENST00000557902 SYNJ1O43426 1573 aa38.66■■■■□ 3.78
ANKRD9-202ENST00000557902 TOP2BQ02880 1626 aa38.66■■■■□ 3.78
ANKRD9-202ENST00000557902 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.64■■■■□ 3.78
ANKRD9-202ENST00000557902 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
ANKRD9-202ENST00000557902 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.6■■■■□ 3.775e-16■■■■■ 45.5
ANKRD9-202ENST00000557902 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
ANKRD9-202ENST00000557902 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
ANKRD9-202ENST00000557902 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.6■■■■□ 3.77
ANKRD9-202ENST00000557902 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
ANKRD9-202ENST00000557902 WDR97A6NE52 1622 aa38.51■■■■□ 3.76
ANKRD9-202ENST00000557902 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.49■■■■□ 3.75
ANKRD9-202ENST00000557902 ARHGEF11O15085 1522 aa38.43■■■■□ 3.74
ANKRD9-202ENST00000557902 CHD1O14646 1710 aa38.32■■■■□ 3.73
ANKRD9-202ENST00000557902 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.31■■■■□ 3.72
ANKRD9-202ENST00000557902 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.3■■■■□ 3.72
ANKRD9-202ENST00000557902 GRIN2BQ13224 1484 aa38.3■■■■□ 3.72
ANKRD9-202ENST00000557902 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.23■■■■□ 3.71
ANKRD9-202ENST00000557902 FBLN2P98095 1184 aa38.23■■■■□ 3.71
ANKRD9-202ENST00000557902 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.23■■■■□ 3.71
ANKRD9-202ENST00000557902 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
ANKRD9-202ENST00000557902 PBRM1Q86U86 1689 aa38.15■■■■□ 3.7
ANKRD9-202ENST00000557902 SYNJ2O15056 1496 aa38.04■■■■□ 3.68
ANKRD9-202ENST00000557902 ARAP1Q96P48 1450 aa38.02■■■■□ 3.68
ANKRD9-202ENST00000557902 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.02■■■■□ 3.68
ANKRD9-202ENST00000557902 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
ANKRD9-202ENST00000557902 KIF27Q86VH2 1401 aa37.94■■■■□ 3.66
ANKRD9-202ENST00000557902 ADAMTS12P58397 1594 aa37.93■■■■□ 3.66
ANKRD9-202ENST00000557902 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
ANKRD9-202ENST00000557902 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.89■■■■□ 3.66
ANKRD9-202ENST00000557902 IGF1RP08069 1367 aa37.83■■■■□ 3.65
ANKRD9-202ENST00000557902 GRIN2AQ12879 1464 aa37.82■■■■□ 3.64
ANKRD9-202ENST00000557902 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.82■■■■□ 3.64
ANKRD9-202ENST00000557902 NUP160Q12769 1436 aa37.7■■■■□ 3.62
ANKRD9-202ENST00000557902 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.65■■■■□ 3.62
ANKRD9-202ENST00000557902 CUL7Q14999 1698 aa37.63■■■■□ 3.61
ANKRD9-202ENST00000557902 CEP170Q5SW79 1584 aa37.62■■■■□ 3.61
ANKRD9-202ENST00000557902 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.57■■■■□ 3.61
ANKRD9-202ENST00000557902 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.51■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms