RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559404.5

ANKRD9-203, Transcript of ankyrin repeat domain 9, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD9, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD9-203ENST00000559404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.5■■■■■ 7.12
ANKRD9-203ENST00000559404 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.48■■■■■ 5.99
ANKRD9-203ENST00000559404 ABCC9O60706 1549 aa50.56■■■■■ 5.68
ANKRD9-203ENST00000559404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.74■■■■■ 5.55
ANKRD9-203ENST00000559404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.44■■■■■ 5.51
ANKRD9-203ENST00000559404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.2■■■■■ 5.47
ANKRD9-203ENST00000559404 NACADO15069 1562 aa49.11■■■■■ 5.45
ANKRD9-203ENST00000559404 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.06■■■■■ 5.44
ANKRD9-203ENST00000559404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.97■■■■■ 5.43
ANKRD9-203ENST00000559404 SCRIBQ14160 1630 aa48.05■■■■■ 5.28
ANKRD9-203ENST00000559404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.98■■■■■ 5.27
ANKRD9-203ENST00000559404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.67■■■■■ 5.22
ANKRD9-203ENST00000559404 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.49■■■■■ 5.19
ANKRD9-203ENST00000559404 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.42■■■■■ 5.18
ANKRD9-203ENST00000559404 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.29■■■■■ 5
ANKRD9-203ENST00000559404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
ANKRD9-203ENST00000559404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
ANKRD9-203ENST00000559404 SMARCA4P51532 1647 aa46■■■■■ 4.95
ANKRD9-203ENST00000559404 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.91■■■■■ 4.94
ANKRD9-203ENST00000559404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.77■■■■■ 4.92
ANKRD9-203ENST00000559404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
ANKRD9-203ENST00000559404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.59■■■■■ 4.89
ANKRD9-203ENST00000559404 WIZO95785 1651 aa45.5■■■■■ 4.87
ANKRD9-203ENST00000559404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.49■■■■■ 4.87
ANKRD9-203ENST00000559404 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.48■■■■■ 4.87
ANKRD9-203ENST00000559404 SMARCA2P51531 1590 aa45.47■■■■■ 4.87
ANKRD9-203ENST00000559404 NCAPD3P42695 1498 aa45.29■■■■■ 4.84
ANKRD9-203ENST00000559404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
ANKRD9-203ENST00000559404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
ANKRD9-203ENST00000559404 HMGXB3Q12766 1538 aa45.17■■■■■ 4.82
ANKRD9-203ENST00000559404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
ANKRD9-203ENST00000559404 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.49■■■■■ 4.71
ANKRD9-203ENST00000559404 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.05■■■■■ 4.64
ANKRD9-203ENST00000559404 NESP48681 1621 aa44.03■■■■■ 4.64
ANKRD9-203ENST00000559404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.98■■■■■ 4.63
ANKRD9-203ENST00000559404 CFTRP13569 1480 aa43.98■■■■■ 4.63
ANKRD9-203ENST00000559404 PRDM2Q13029 1718 aa43.79■■■■■ 4.6
ANKRD9-203ENST00000559404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.64■■■■■ 4.58
ANKRD9-203ENST00000559404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.57■■■■■ 4.57
ANKRD9-203ENST00000559404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.56■■■■■ 4.56
ANKRD9-203ENST00000559404 ERCC6Q03468 1493 aa43.48■■■■■ 4.55
ANKRD9-203ENST00000559404 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.42■■■■■ 4.54
ANKRD9-203ENST00000559404 ABCC8Q09428 1581 aa43.19■■■■■ 4.51
ANKRD9-203ENST00000559404 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.16■■■■■ 4.5
ANKRD9-203ENST00000559404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
ANKRD9-203ENST00000559404 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
ANKRD9-203ENST00000559404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
ANKRD9-203ENST00000559404 CUX1P39880 1505 aa43.01■■■■■ 4.48
ANKRD9-203ENST00000559404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43■■■■■ 4.47
ANKRD9-203ENST00000559404 WDR62O43379 1518 aa42.99■■■■■ 4.47
ANKRD9-203ENST00000559404 TOPBP1Q92547 1522 aa42.98■■■■■ 4.47
ANKRD9-203ENST00000559404 SYNJ1O43426 1573 aa42.94■■■■■ 4.46
ANKRD9-203ENST00000559404 TOP2BQ02880 1626 aa42.86■■■■■ 4.45
ANKRD9-203ENST00000559404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.86■■■■■ 4.45
ANKRD9-203ENST00000559404 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.76■■■■■ 4.44
ANKRD9-203ENST00000559404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.71■■■■■ 4.43
ANKRD9-203ENST00000559404 TRIM41Q8WV44 630 aa42.69■■■■■ 4.42
ANKRD9-203ENST00000559404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
ANKRD9-203ENST00000559404 CUX2O14529 1486 aa42.63■■■■■ 4.42
ANKRD9-203ENST00000559404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.52■■■■■ 4.4
ANKRD9-203ENST00000559404 SOGA1O94964 1423 aa42.5■■■■■ 4.39
ANKRD9-203ENST00000559404 IFT140Q96RY7 1462 aa42.45■■■■■ 4.39
ANKRD9-203ENST00000559404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
ANKRD9-203ENST00000559404 WDR97A6NE52 1622 aa42.33■■■■■ 4.37
ANKRD9-203ENST00000559404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.31■■■■■ 4.36
ANKRD9-203ENST00000559404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
ANKRD9-203ENST00000559404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
ANKRD9-203ENST00000559404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.335e-16■■■■■ 45.5
ANKRD9-203ENST00000559404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
ANKRD9-203ENST00000559404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.09■■■■■ 4.33
ANKRD9-203ENST00000559404 KIF27Q86VH2 1401 aa42.06■■■■■ 4.32
ANKRD9-203ENST00000559404 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.04■■■■■ 4.32
ANKRD9-203ENST00000559404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.04■■■■■ 4.32
ANKRD9-203ENST00000559404 PBRM1Q86U86 1689 aa41.95■■■■■ 4.31
ANKRD9-203ENST00000559404 GRIN2BQ13224 1484 aa41.89■■■■■ 4.3
ANKRD9-203ENST00000559404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
ANKRD9-203ENST00000559404 EEA1Q15075 1411 aa41.82■■■■■ 4.28
ANKRD9-203ENST00000559404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.81■■■■■ 4.28
ANKRD9-203ENST00000559404 IGF1RP08069 1367 aa41.79■■■■■ 4.28
ANKRD9-203ENST00000559404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.74■■■■■ 4.27
ANKRD9-203ENST00000559404 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.69■■■■■ 4.26
ANKRD9-203ENST00000559404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
ANKRD9-203ENST00000559404 CUL7Q14999 1698 aa41.63■■■■■ 4.26
ANKRD9-203ENST00000559404 ADAMTS12P58397 1594 aa41.62■■■■■ 4.25
ANKRD9-203ENST00000559404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.56■■■■■ 4.24
ANKRD9-203ENST00000559404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.56■■■■■ 4.24
ANKRD9-203ENST00000559404 SYNJ2O15056 1496 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD9-203ENST00000559404 PRXQ9BXM0 1461 aa41.49■■■■■ 4.23
ANKRD9-203ENST00000559404 FBLN2P98095 1184 aa41.47■■■■■ 4.23
ANKRD9-203ENST00000559404 CHD1O14646 1710 aa41.45■■■■■ 4.23
ANKRD9-203ENST00000559404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
ANKRD9-203ENST00000559404 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.42■■■■■ 4.22
ANKRD9-203ENST00000559404 KIF21BO75037 1637 aa41.37■■■■■ 4.21
ANKRD9-203ENST00000559404 GRIN2AQ12879 1464 aa41.37■■■■■ 4.21
ANKRD9-203ENST00000559404 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.3■■■■■ 4.2
ANKRD9-203ENST00000559404 GOLGA3Q08378 1498 aa41.2■■■■■ 4.19
ANKRD9-203ENST00000559404 CEP170Q5SW79 1584 aa41.15■■■■■ 4.18
ANKRD9-203ENST00000559404 NUP160Q12769 1436 aa41.12■■■■■ 4.17
ANKRD9-203ENST00000559404 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.07■■■■■ 4.16
ANKRD9-203ENST00000559404 OSCARQ8IYS5 282 aa41.07■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms