Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.475e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.535e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-221ENST00000614198 3438 ntTSL 211.74□□□□□ -0.535e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-201ENST00000537686 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-222ENST00000621217 4181 ntTSL 210.5□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-223ENST00000621870 4034 ntTSL 1 (best)10.24□□□□□ -0.775e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.845e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.857e-10■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.067e-10■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 NSA2-202ENST00000513356 797 ntTSL 36.8□□□□□ -1.325e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 NSA2-204ENST00000515524 448 ntTSL 26.23□□□□□ -1.415e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 YWHAQ-205ENST00000474715 709 ntTSL 35.91□□□□□ -1.465e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SRP72-204ENST00000507126 2181 ntTSL 1 (best)3.66□□□□□ -1.825e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 511.66□□□□□ -0.543e-7■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-7■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.713e-7■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.813e-7■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.913e-7■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC8.14□□□□□ -1.111e-69■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.775e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 LINC00888-203ENST00000482098 794 ntTSL 28.18□□□□□ -1.15e-43■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.795e-43■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPRY4-205ENST00000511815 553 ntTSL 422.44■■□□□ 1.181e-12■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPRY4-203ENST00000503582 575 ntTSL 419.38■□□□□ 0.691e-12■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-12■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-12■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SLC38A2-203ENST00000547252 847 ntTSL 39.42□□□□□ -0.93e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CFB-272ENST00000452035 1866 ntTSL 217.68■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-16■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.122e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 213.9□□□□□ -0.182e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-34■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 C3-217ENST00000602053 621 ntTSL 28.61□□□□□ -1.032e-44■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 24.77□□□□□ -1.653e-9■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.45e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.755e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-206ENST00000528296 540 ntTSL 318.78■□□□□ 0.65e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-209ENST00000529920 876 ntTSL 218.73■□□□□ 0.595e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-213ENST00000533397 730 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.465e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.45e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-212ENST00000532702 745 ntTSL 216.87■□□□□ 0.295e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.255e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-214ENST00000534781 716 ntTSL 215.68■□□□□ 0.15e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-211ENST00000531975 698 ntTSL 313.45□□□□□ -0.265e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL8-208ENST00000529163 556 ntTSL 212.62□□□□□ -0.395e-12■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.793e-8■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 518.12■□□□□ 0.492e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 515.43■□□□□ 0.062e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-323■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 KIAA0907-208ENST00000482337 1135 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.681e-323■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.821e-323■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.5□□□□□ -1.851e-323■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-211ENST00000532025 653 ntTSL 318.66■□□□□ 0.581e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.51e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 516.67■□□□□ 0.261e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CLNS1A-207ENST00000527133 667 ntTSL 314.16□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-207ENST00000527982 2200 nt12.62□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 511.33□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL17-216ENST00000582935 469 ntTSL 212.94□□□□□ -0.343e-31■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 RPL17-213ENST00000581741 596 ntTSL 28.59□□□□□ -1.033e-31■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 234.73■■■■□ 3.157e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.998e-9■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.757e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.47e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.058e-9■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CERS2-209ENST00000482825 1618 ntTSL 515.36■□□□□ 0.057e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.117e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CERS2-213ENST00000560793 1661 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.617e-7■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 DDX5-209ENST00000578758 667 ntTSL 210.82□□□□□ -0.681e-8■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 DDX5-216ENST00000581237 592 ntTSL 58.04□□□□□ -1.121e-8■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.163e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.013e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.363e-10■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.558e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.728e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 28.39□□□□□ -1.078e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.168e-13■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.195e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.045e-25■□□□□ 9.1
NOLC1Q14978 GANAB-203ENST00000524437 671 ntTSL 221■□□□□ 0.953e-11■□□□□ 9.1
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