Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNIP3Q9Y2W7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP3Q9Y2W7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms