Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLN6Q9NWW5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLN6Q9NWW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLN6Q9NWW5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLN6Q9NWW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms