Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK9Q9NPC2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KCNK9Q9NPC2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNK9Q9NPC2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK9Q9NPC2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK9Q9NPC2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK9Q9NPC2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms