Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCPEP1Q9HB40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCPEP1Q9HB40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCPEP1Q9HB40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCPEP1Q9HB40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms