Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROPN1Q9HAT0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ROPN1Q9HAT0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROPN1Q9HAT0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROPN1Q9HAT0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ROPN1Q9HAT0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROPN1Q9HAT0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROPN1Q9HAT0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms