Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRC1Q9BTT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC1Q9BTT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC1Q9BTT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC1Q9BTT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC1Q9BTT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms