Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBLCP1Q8WVY7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBLCP1Q8WVY7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBLCP1Q8WVY7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBLCP1Q8WVY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBLCP1Q8WVY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms