Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMCE1Q8WV22 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NSMCE1Q8WV22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSMCE1Q8WV22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSMCE1Q8WV22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSMCE1Q8WV22 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms