Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG16L2Q8NAA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG16L2Q8NAA4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG16L2Q8NAA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG16L2Q8NAA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG16L2Q8NAA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms