Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC36A3Q495N2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC36A3Q495N2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A3Q495N2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A3Q495N2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A3Q495N2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms