Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM25Q14258 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM25Q14258 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM25Q14258 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
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