Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
IRX6P78412 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
IRX6P78412 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IRX6P78412 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IRX6P78412 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IRX6P78412 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRX6P78412 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRX6P78412 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRX6P78412 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRX6P78412 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IRX6P78412 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IRX6P78412 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IRX6P78412 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IRX6P78412 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IRX6P78412 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
IRX6P78412 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IRX6P78412 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IRX6P78412 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IRX6P78412 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IRX6P78412 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IRX6P78412 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
IRX6P78412 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IRX6P78412 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IRX6P78412 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IRX6P78412 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IRX6P78412 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IRX6P78412 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
IRX6P78412 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
IRX6P78412 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IRX6P78412 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IRX6P78412 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IRX6P78412 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IRX6P78412 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IRX6P78412 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IRX6P78412 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IRX6P78412 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IRX6P78412 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IRX6P78412 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IRX6P78412 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IRX6P78412 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IRX6P78412 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IRX6P78412 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IRX6P78412 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IRX6P78412 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IRX6P78412 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IRX6P78412 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IRX6P78412 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IRX6P78412 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IRX6P78412 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IRX6P78412 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IRX6P78412 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IRX6P78412 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IRX6P78412 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IRX6P78412 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
IRX6P78412 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX6P78412 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX6P78412 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX6P78412 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX6P78412 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX6P78412 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IRX6P78412 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IRX6P78412 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IRX6P78412 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IRX6P78412 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IRX6P78412 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
IRX6P78412 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IRX6P78412 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IRX6P78412 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IRX6P78412 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
IRX6P78412 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IRX6P78412 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IRX6P78412 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
IRX6P78412 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
IRX6P78412 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
IRX6P78412 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IRX6P78412 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IRX6P78412 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IRX6P78412 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IRX6P78412 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IRX6P78412 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IRX6P78412 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IRX6P78412 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IRX6P78412 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IRX6P78412 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IRX6P78412 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IRX6P78412 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IRX6P78412 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IRX6P78412 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IRX6P78412 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IRX6P78412 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IRX6P78412 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
IRX6P78412 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IRX6P78412 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IRX6P78412 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IRX6P78412 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IRX6P78412 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IRX6P78412 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IRX6P78412 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IRX6P78412 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IRX6P78412 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms