Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PLA2G16P53816 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLA2G16P53816 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLA2G16P53816 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLA2G16P53816 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLA2G16P53816 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms