Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB2P52799 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB2P52799 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFNB2P52799 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNB2P52799 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms