Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFNB2P52799 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFNB2P52799 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFNB2P52799 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFNB2P52799 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFNB2P52799 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFNB2P52799 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFNB2P52799 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFNB2P52799 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNB2P52799 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFNB2P52799 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFNB2P52799 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EFNB2P52799 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EFNB2P52799 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EFNB2P52799 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EFNB2P52799 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFNB2P52799 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNB2P52799 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFNB2P52799 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFNB2P52799 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFNB2P52799 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFNB2P52799 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFNB2P52799 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFNB2P52799 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EFNB2P52799 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFNB2P52799 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFNB2P52799 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFNB2P52799 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFNB2P52799 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFNB2P52799 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFNB2P52799 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFNB2P52799 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFNB2P52799 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFNB2P52799 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFNB2P52799 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFNB2P52799 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFNB2P52799 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFNB2P52799 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFNB2P52799 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFNB2P52799 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFNB2P52799 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFNB2P52799 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFNB2P52799 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFNB2P52799 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFNB2P52799 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFNB2P52799 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFNB2P52799 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFNB2P52799 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EFNB2P52799 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EFNB2P52799 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFNB2P52799 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFNB2P52799 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFNB2P52799 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFNB2P52799 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFNB2P52799 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFNB2P52799 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EFNB2P52799 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFNB2P52799 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFNB2P52799 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFNB2P52799 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFNB2P52799 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFNB2P52799 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFNB2P52799 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFNB2P52799 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFNB2P52799 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFNB2P52799 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFNB2P52799 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFNB2P52799 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFNB2P52799 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFNB2P52799 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFNB2P52799 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFNB2P52799 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFNB2P52799 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFNB2P52799 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFNB2P52799 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFNB2P52799 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNB2P52799 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFNB2P52799 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNB2P52799 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB2P52799 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNB2P52799 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNB2P52799 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFNB2P52799 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNB2P52799 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNB2P52799 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNB2P52799 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms