Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV1P50549 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV1P50549 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ETV1P50549 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV1P50549 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ETV1P50549 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV1P50549 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ETV1P50549 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ETV1P50549 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV1P50549 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV1P50549 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV1P50549 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ETV1P50549 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ETV1P50549 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV1P50549 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV1P50549 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV1P50549 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ETV1P50549 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV1P50549 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV1P50549 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV1P50549 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV1P50549 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV1P50549 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ETV1P50549 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV1P50549 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV1P50549 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ETV1P50549 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV1P50549 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV1P50549 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV1P50549 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV1P50549 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ETV1P50549 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV1P50549 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ETV1P50549 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV1P50549 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ETV1P50549 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV1P50549 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV1P50549 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV1P50549 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ETV1P50549 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV1P50549 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV1P50549 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ETV1P50549 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV1P50549 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV1P50549 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV1P50549 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ETV1P50549 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV1P50549 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV1P50549 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV1P50549 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV1P50549 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ETV1P50549 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ETV1P50549 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV1P50549 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV1P50549 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ETV1P50549 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV1P50549 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV1P50549 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV1P50549 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ETV1P50549 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ETV1P50549 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ETV1P50549 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ETV1P50549 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV1P50549 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV1P50549 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV1P50549 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ETV1P50549 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV1P50549 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV1P50549 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV1P50549 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ETV1P50549 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV1P50549 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV1P50549 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV1P50549 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ETV1P50549 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV1P50549 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV1P50549 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ETV1P50549 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ETV1P50549 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV1P50549 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV1P50549 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ETV1P50549 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms