Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3P25205 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM3P25205 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM3P25205 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM3P25205 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM3P25205 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM3P25205 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM3P25205 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3P25205 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCM3P25205 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3P25205 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3P25205 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3P25205 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3P25205 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3P25205 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCM3P25205 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCM3P25205 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3P25205 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3P25205 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCM3P25205 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3P25205 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3P25205 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCM3P25205 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM3P25205 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCM3P25205 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCM3P25205 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3P25205 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3P25205 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3P25205 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCM3P25205 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM3P25205 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM3P25205 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCM3P25205 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCM3P25205 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCM3P25205 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM3P25205 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM3P25205 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM3P25205 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3P25205 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM3P25205 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCM3P25205 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3P25205 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3P25205 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3P25205 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM3P25205 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3P25205 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3P25205 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3P25205 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3P25205 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3P25205 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM3P25205 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM3P25205 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM3P25205 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM3P25205 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM3P25205 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCM3P25205 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCM3P25205 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM3P25205 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM3P25205 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM3P25205 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM3P25205 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM3P25205 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM3P25205 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM3P25205 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM3P25205 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM3P25205 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM3P25205 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM3P25205 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM3P25205 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM3P25205 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM3P25205 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM3P25205 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM3P25205 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM3P25205 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM3P25205 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM3P25205 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM3P25205 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM3P25205 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM3P25205 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM3P25205 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM3P25205 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM3P25205 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM3P25205 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM3P25205 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM3P25205 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms