Protein–RNA interactions for Protein: P17568

NDUFB7, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB7P17568 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFB7P17568 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFB7P17568 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFB7P17568 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFB7P17568 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDUFB7P17568 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms