Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB1P16220 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB1P16220 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB1P16220 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB1P16220 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB1P16220 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB1P16220 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB1P16220 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB1P16220 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB1P16220 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB1P16220 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB1P16220 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB1P16220 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB1P16220 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB1P16220 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB1P16220 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB1P16220 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB1P16220 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CREB1P16220 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB1P16220 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CREB1P16220 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB1P16220 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB1P16220 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB1P16220 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB1P16220 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB1P16220 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB1P16220 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB1P16220 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB1P16220 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB1P16220 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB1P16220 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB1P16220 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB1P16220 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB1P16220 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB1P16220 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB1P16220 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB1P16220 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB1P16220 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB1P16220 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB1P16220 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB1P16220 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB1P16220 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB1P16220 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB1P16220 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB1P16220 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB1P16220 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB1P16220 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB1P16220 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB1P16220 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CREB1P16220 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB1P16220 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CREB1P16220 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CREB1P16220 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CREB1P16220 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CREB1P16220 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CREB1P16220 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB1P16220 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB1P16220 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB1P16220 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CREB1P16220 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB1P16220 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB1P16220 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB1P16220 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CREB1P16220 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB1P16220 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CREB1P16220 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CREB1P16220 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB1P16220 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB1P16220 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB1P16220 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB1P16220 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB1P16220 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CREB1P16220 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB1P16220 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB1P16220 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CREB1P16220 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB1P16220 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB1P16220 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB1P16220 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB1P16220 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB1P16220 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CREB1P16220 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB1P16220 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB1P16220 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB1P16220 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CREB1P16220 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms