Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00869P0C866 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LINC00869P0C866 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00869P0C866 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00869P0C866 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms