Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHBGP04278 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHBGP04278 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHBGP04278 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHBGP04278 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHBGP04278 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHBGP04278 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHBGP04278 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHBGP04278 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHBGP04278 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHBGP04278 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHBGP04278 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHBGP04278 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHBGP04278 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHBGP04278 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SHBGP04278 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHBGP04278 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHBGP04278 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHBGP04278 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHBGP04278 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHBGP04278 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHBGP04278 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHBGP04278 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHBGP04278 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SHBGP04278 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHBGP04278 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHBGP04278 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHBGP04278 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHBGP04278 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHBGP04278 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHBGP04278 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHBGP04278 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHBGP04278 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHBGP04278 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHBGP04278 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHBGP04278 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHBGP04278 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHBGP04278 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHBGP04278 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHBGP04278 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHBGP04278 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHBGP04278 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHBGP04278 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHBGP04278 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHBGP04278 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHBGP04278 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHBGP04278 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHBGP04278 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHBGP04278 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHBGP04278 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHBGP04278 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHBGP04278 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHBGP04278 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHBGP04278 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHBGP04278 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHBGP04278 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHBGP04278 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHBGP04278 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHBGP04278 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHBGP04278 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHBGP04278 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHBGP04278 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHBGP04278 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHBGP04278 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHBGP04278 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHBGP04278 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHBGP04278 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHBGP04278 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHBGP04278 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHBGP04278 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHBGP04278 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHBGP04278 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHBGP04278 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHBGP04278 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHBGP04278 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHBGP04278 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHBGP04278 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHBGP04278 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHBGP04278 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHBGP04278 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHBGP04278 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHBGP04278 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHBGP04278 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHBGP04278 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHBGP04278 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHBGP04278 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHBGP04278 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHBGP04278 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHBGP04278 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHBGP04278 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHBGP04278 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHBGP04278 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SHBGP04278 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHBGP04278 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms