Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0U1RQJ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0U1RQJ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A0U1RQJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A0U1RQJ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0U1RQJ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0U1RQJ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms