Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 SLC25A36-210ENST00000512023 817 ntTSL 58.69□□□□□ -1.027e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-211ENST00000512506 727 ntTSL 56.85□□□□□ -1.317e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-209ENST00000511757 1307 ntTSL 26.74□□□□□ -1.337e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 SLC25A36-207ENST00000502866 598 ntTSL 45.49□□□□□ -1.537e-13■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-216ENST00000564136 3071 ntTSL 215.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 28.7
SF3A3Q12874 HAUS4-216ENST00000555040 1107 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 HAUS4-220ENST00000556915 578 ntTSL 310.95□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 GNAS-254ENST00000494081 557 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 TTC38-205ENST00000451998 582 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-205ENST00000422445 1739 ntTSL 524.83■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 ATP8B2-204ENST00000426445 2118 ntTSL 524.3■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-206ENST00000427443 1909 ntTSL 1 (best)20.31■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-204ENST00000418480 829 ntTSL 518.13■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-207ENST00000447443 576 ntTSL 516.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 FANCA-226ENST00000567879 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.01□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 311.55□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 FANCA-215ENST00000564475 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.01□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 FANCA-209ENST00000562424 745 ntTSL 210.19□□□□□ -0.786e-8■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 FANCA-216ENST00000564870 460 ntTSL 38.33□□□□□ -1.086e-8■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SFXN5-208ENST00000463277 575 ntTSL 410.56□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 SFXN5-209ENST00000464825 532 ntTSL 47.75□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 PRSS53-203ENST00000492427 1782 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 28.6
SF3A3Q12874 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 CCDC183-203ENST00000430612 2321 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 CCDC183-205ENST00000481601 1556 ntTSL 214.79□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 313.94□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 HGS-204ENST00000571237 878 ntTSL 314.44□□□□□ -0.12e-14■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 317.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 EXOC3L4-202ENST00000559116 460 ntTSL 515.69■□□□□ 0.13e-11■■■■■ 28.5
SF3A3Q12874 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 224.56■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 324.56■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 523.85■■□□□ 1.414e-9■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.235e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 320.72■□□□□ 0.914e-9■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ADCK5-205ENST00000529654 2027 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 AGAP3-219ENST00000485904 683 ntTSL 318.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 217■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-210ENST00000447379 716 ntTSL 514.83□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 28.4
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SF3A3Q12874 CTSB-225ENST00000532409 839 ntTSL 213.88□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 DPH7-202ENST00000460572 394 ntTSL 513.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 DPH7-208ENST00000476303 922 ntTSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.35e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 CTSB-218ENST00000530624 430 ntTSL 512.65□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-206ENST00000422297 799 ntTSL 311.54□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 DPH7-204ENST00000467768 750 ntTSL 511.29□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 310.94□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-208ENST00000425237 806 ntTSL 310.73□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NEK6-207ENST00000423785 726 ntTSL 510.43□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MSL1-208ENST00000581246 583 ntTSL 410.1□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 DPH7-211ENST00000481839 798 ntTSL 39.62□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 RNF213-205ENST00000558116 3768 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 DPH7-205ENST00000470855 479 ntTSL 58.46□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 CTSB-227ENST00000533110 399 ntTSL 57.09□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MSL1-209ENST00000582884 580 ntTSL 55.17□□□□□ -1.585e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MSL1-201ENST00000339569 3424 ntTSL 24.58□□□□□ -1.685e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 CTSB-216ENST00000530290 498 ntTSL 34.42□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.521e-14■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-207ENST00000471125 612 ntTSL 318.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-211ENST00000495220 747 ntTSL 218.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-202ENST00000419386 829 ntTSL 318.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-204ENST00000461627 882 ntTSL 218.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-205ENST00000466367 866 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-212ENST00000497877 831 ntTSL 517.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-210ENST00000491911 3185 ntTSL 215.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-209ENST00000483563 704 ntTSL 315.58■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 ARRDC1-203ENST00000431925 555 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 516.84■□□□□ 0.297e-17■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 NDRG1-216ENST00000521026 2145 ntTSL 214.89□□□□□ -0.037e-21■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 POLD1-212ENST00000600859 3474 ntTSL 215.53■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 28.4
SF3A3Q12874 RTEL1-206ENST00000425905 664 ntTSL 211.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 28.3
SF3A3Q12874 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 313.01□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 28.3
SF3A3Q12874 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 28.3
SF3A3Q12874 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 28.3
SF3A3Q12874 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 28.3
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