Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms