RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557807.1

C15orf61-202, Transcript of chromosome 15 open reading frame 61, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C15orf61, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf61-202ENST00000557807 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.18■■■■■ 6.26
C15orf61-202ENST00000557807 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.32■■■■■ 5.33
C15orf61-202ENST00000557807 ABCC9O60706 1549 aa47.31■■■■■ 5.16
C15orf61-202ENST00000557807 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.5■■■■■ 4.87
C15orf61-202ENST00000557807 NACADO15069 1562 aa45.4■■■■■ 4.86
C15orf61-202ENST00000557807 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.21■■■■■ 4.83
C15orf61-202ENST00000557807 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
C15orf61-202ENST00000557807 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.08■■■■■ 4.81
C15orf61-202ENST00000557807 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.84■■■■■ 4.77
C15orf61-202ENST00000557807 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.55■■■■■ 4.72
C15orf61-202ENST00000557807 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.12■■■■■ 4.65
C15orf61-202ENST00000557807 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.11■■■■■ 4.65
C15orf61-202ENST00000557807 SCRIBQ14160 1630 aa44.04■■■■■ 4.64
C15orf61-202ENST00000557807 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.66■■■■■ 4.58
C15orf61-202ENST00000557807 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.46■■■■■ 4.55
C15orf61-202ENST00000557807 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
C15orf61-202ENST00000557807 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.83■■■■■ 4.45
C15orf61-202ENST00000557807 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.52■■■■■ 4.4
C15orf61-202ENST00000557807 SMARCA4P51532 1647 aa42.12■■■■■ 4.33
C15orf61-202ENST00000557807 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
C15orf61-202ENST00000557807 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.86■■■■■ 4.29
C15orf61-202ENST00000557807 NCAPD3P42695 1498 aa41.85■■■■■ 4.29
C15orf61-202ENST00000557807 SMARCA2P51531 1590 aa41.84■■■■■ 4.29
C15orf61-202ENST00000557807 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.76■■■■■ 4.27
C15orf61-202ENST00000557807 HMGXB3Q12766 1538 aa41.7■■■■■ 4.27
C15orf61-202ENST00000557807 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.7■■■■■ 4.27
C15orf61-202ENST00000557807 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
C15orf61-202ENST00000557807 WIZO95785 1651 aa41.33■■■■■ 4.21
C15orf61-202ENST00000557807 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
C15orf61-202ENST00000557807 NESP48681 1621 aa40.9■■■■■ 4.14
C15orf61-202ENST00000557807 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
C15orf61-202ENST00000557807 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.82■■■■■ 4.13
C15orf61-202ENST00000557807 ERCC6Q03468 1493 aa40.79■■■■■ 4.12
C15orf61-202ENST00000557807 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.61■■■■■ 4.09
C15orf61-202ENST00000557807 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.5■■■■■ 4.07
C15orf61-202ENST00000557807 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.5■■■■■ 4.07
C15orf61-202ENST00000557807 CUX2O14529 1486 aa40.43■■■■■ 4.06
C15orf61-202ENST00000557807 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
C15orf61-202ENST00000557807 CFTRP13569 1480 aa40.37■■■■■ 4.05
C15orf61-202ENST00000557807 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.35■■■■■ 4.05
C15orf61-202ENST00000557807 PRDM2Q13029 1718 aa40.2■■■■■ 4.03
C15orf61-202ENST00000557807 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.18■■■■■ 4.02
C15orf61-202ENST00000557807 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.16■■■■■ 4.02
C15orf61-202ENST00000557807 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.13■■■■■ 4.01
C15orf61-202ENST00000557807 WDR62O43379 1518 aa40.02■■■■■ 4
C15orf61-202ENST00000557807 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
C15orf61-202ENST00000557807 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
C15orf61-202ENST00000557807 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
C15orf61-202ENST00000557807 ABCC8Q09428 1581 aa39.5■■■■□ 3.91
C15orf61-202ENST00000557807 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.5■■■■□ 3.91
C15orf61-202ENST00000557807 IFT140Q96RY7 1462 aa39.3■■■■□ 3.88
C15orf61-202ENST00000557807 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.25■■■■□ 3.87
C15orf61-202ENST00000557807 CUX1P39880 1505 aa39.19■■■■□ 3.86
C15orf61-202ENST00000557807 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
C15orf61-202ENST00000557807 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
C15orf61-202ENST00000557807 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
C15orf61-202ENST00000557807 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.08■■■■□ 3.85
C15orf61-202ENST00000557807 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
C15orf61-202ENST00000557807 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.99■■■■□ 3.83
C15orf61-202ENST00000557807 SOGA1O94964 1423 aa38.97■■■■□ 3.83
C15orf61-202ENST00000557807 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.87■■■■□ 3.81
C15orf61-202ENST00000557807 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.87■■■■□ 3.81
C15orf61-202ENST00000557807 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.87■■■■□ 3.81
C15orf61-202ENST00000557807 WDR97A6NE52 1622 aa38.85■■■■□ 3.81
C15orf61-202ENST00000557807 TOP2BQ02880 1626 aa38.84■■■■□ 3.81
C15orf61-202ENST00000557807 SYNJ1O43426 1573 aa38.82■■■■□ 3.81
C15orf61-202ENST00000557807 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
C15orf61-202ENST00000557807 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.69■■■■□ 3.78
C15orf61-202ENST00000557807 OSCARQ8IYS5 282 aa38.64■■■■□ 3.78
C15orf61-202ENST00000557807 CHD1O14646 1710 aa38.6■■■■□ 3.77
C15orf61-202ENST00000557807 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.6■■■■□ 3.77
C15orf61-202ENST00000557807 PBRM1Q86U86 1689 aa38.58■■■■□ 3.77
C15orf61-202ENST00000557807 GRIN2BQ13224 1484 aa38.57■■■■□ 3.76
C15orf61-202ENST00000557807 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.56■■■■□ 3.76
C15orf61-202ENST00000557807 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.55■■■■□ 3.76
C15orf61-202ENST00000557807 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
C15orf61-202ENST00000557807 FBLN2P98095 1184 aa38.39■■■■□ 3.74
C15orf61-202ENST00000557807 SYNJ2O15056 1496 aa38.35■■■■□ 3.73
C15orf61-202ENST00000557807 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
C15orf61-202ENST00000557807 ADAMTS12P58397 1594 aa38.24■■■■□ 3.71
C15orf61-202ENST00000557807 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.24■■■■□ 3.71
C15orf61-202ENST00000557807 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
C15orf61-202ENST00000557807 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
C15orf61-202ENST00000557807 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
C15orf61-202ENST00000557807 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.14■■■■□ 3.7
C15orf61-202ENST00000557807 ARHGEF11O15085 1522 aa38.11■■■■□ 3.69
C15orf61-202ENST00000557807 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.1■■■■□ 3.69
C15orf61-202ENST00000557807 GRIN2AQ12879 1464 aa38.09■■■■□ 3.69
C15orf61-202ENST00000557807 KIF27Q86VH2 1401 aa38.05■■■■□ 3.68
C15orf61-202ENST00000557807 CEP170Q5SW79 1584 aa37.93■■■■□ 3.66
C15orf61-202ENST00000557807 TRIM41Q8WV44 630 aa37.92■■■■□ 3.66
C15orf61-202ENST00000557807 NUP160Q12769 1436 aa37.92■■■■□ 3.66
C15orf61-202ENST00000557807 CUL7Q14999 1698 aa37.91■■■■□ 3.66
C15orf61-202ENST00000557807 IGF1RP08069 1367 aa37.88■■■■□ 3.65
C15orf61-202ENST00000557807 ARAP1Q96P48 1450 aa37.79■■■■□ 3.64
C15orf61-202ENST00000557807 SHROOM2Q13796 1616 aa37.7■■■■□ 3.63
C15orf61-202ENST00000557807 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.68■■■■□ 3.62
C15orf61-202ENST00000557807 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.67■■■■□ 3.62
C15orf61-202ENST00000557807 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.66■■■■□ 3.62
C15orf61-202ENST00000557807 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.59■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms