RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440234.6

RBM38-205, Transcript of RNA binding motif protein 38, humanhuman

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Gene RBM38, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38-205ENST00000440234 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.56■■■■■ 6.32
RBM38-205ENST00000440234 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.76■■■■■ 5.4
RBM38-205ENST00000440234 ABCC9O60706 1549 aa48.71■■■■■ 5.39
RBM38-205ENST00000440234 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.39■■■■■ 5.02
RBM38-205ENST00000440234 NACADO15069 1562 aa46.15■■■■■ 4.98
RBM38-205ENST00000440234 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.11■■■■■ 4.97
RBM38-205ENST00000440234 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.63■■■■■ 4.9
RBM38-205ENST00000440234 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.61■■■■■ 4.89
RBM38-205ENST00000440234 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
RBM38-205ENST00000440234 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
RBM38-205ENST00000440234 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.21■■■■■ 4.83
RBM38-205ENST00000440234 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.08■■■■■ 4.81
RBM38-205ENST00000440234 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.03■■■■■ 4.8
RBM38-205ENST00000440234 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.47■■■■■ 4.71
RBM38-205ENST00000440234 SCRIBQ14160 1630 aa44.46■■■■■ 4.71
RBM38-205ENST00000440234 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.95■■■■■ 4.63
RBM38-205ENST00000440234 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
RBM38-205ENST00000440234 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.87■■■■■ 4.61
RBM38-205ENST00000440234 NCAPD3P42695 1498 aa42.68■■■■■ 4.42
RBM38-205ENST00000440234 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.55■■■■■ 4.4
RBM38-205ENST00000440234 SMARCA4P51532 1647 aa42.46■■■■■ 4.39
RBM38-205ENST00000440234 SMARCA2P51531 1590 aa42.39■■■■■ 4.38
RBM38-205ENST00000440234 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
RBM38-205ENST00000440234 HMGXB3Q12766 1538 aa42.28■■■■■ 4.36
RBM38-205ENST00000440234 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
RBM38-205ENST00000440234 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.07■■■■■ 4.33
RBM38-205ENST00000440234 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.04■■■■■ 4.32
RBM38-205ENST00000440234 ERCC6Q03468 1493 aa42.04■■■■■ 4.32
RBM38-205ENST00000440234 CUX2O14529 1486 aa41.9■■■■■ 4.3
RBM38-205ENST00000440234 NESP48681 1621 aa41.88■■■■■ 4.3
RBM38-205ENST00000440234 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.78■■■■■ 4.28
RBM38-205ENST00000440234 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.59■■■■■ 4.25
RBM38-205ENST00000440234 WIZO95785 1651 aa41.48■■■■■ 4.23
RBM38-205ENST00000440234 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.44■■■■■ 4.22
RBM38-205ENST00000440234 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.4■■■■■ 4.22
RBM38-205ENST00000440234 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
RBM38-205ENST00000440234 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
RBM38-205ENST00000440234 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.23■■■■■ 4.19
RBM38-205ENST00000440234 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.01■■■■■ 4.16
RBM38-205ENST00000440234 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
RBM38-205ENST00000440234 CFTRP13569 1480 aa40.94■■■■■ 4.14
RBM38-205ENST00000440234 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.88■■■■■ 4.13
RBM38-205ENST00000440234 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.88■■■■■ 4.13
RBM38-205ENST00000440234 WDR62O43379 1518 aa40.87■■■■■ 4.13
RBM38-205ENST00000440234 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.6■■■■■ 4.09
RBM38-205ENST00000440234 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
RBM38-205ENST00000440234 PRDM2Q13029 1718 aa40.3■■■■■ 4.04
RBM38-205ENST00000440234 OSCARQ8IYS5 282 aa40.15■■■■■ 4.02
RBM38-205ENST00000440234 TOPBP1Q92547 1522 aa40.11■■■■■ 4.01
RBM38-205ENST00000440234 IFT140Q96RY7 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
RBM38-205ENST00000440234 ABCC8Q09428 1581 aa40.08■■■■■ 4.01
RBM38-205ENST00000440234 TRIM41Q8WV44 630 aa39.99■■■■□ 3.99
RBM38-205ENST00000440234 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
RBM38-205ENST00000440234 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.94■■■■□ 3.98
RBM38-205ENST00000440234 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
RBM38-205ENST00000440234 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
RBM38-205ENST00000440234 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.69■■■■□ 3.942e-9■■■■■ 29.3
RBM38-205ENST00000440234 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
RBM38-205ENST00000440234 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
RBM38-205ENST00000440234 SOGA1O94964 1423 aa39.6■■■■□ 3.93
RBM38-205ENST00000440234 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.58■■■■□ 3.93
RBM38-205ENST00000440234 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
RBM38-205ENST00000440234 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.49■■■■□ 3.91
RBM38-205ENST00000440234 CUX1P39880 1505 aa39.47■■■■□ 3.91
RBM38-205ENST00000440234 FBLN2P98095 1184 aa39.45■■■■□ 3.91
RBM38-205ENST00000440234 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
RBM38-205ENST00000440234 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
RBM38-205ENST00000440234 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.4■■■■□ 3.9
RBM38-205ENST00000440234 ARHGEF11O15085 1522 aa39.35■■■■□ 3.89
RBM38-205ENST00000440234 CHD1O14646 1710 aa39.31■■■■□ 3.88
RBM38-205ENST00000440234 WDR97A6NE52 1622 aa39.29■■■■□ 3.88
RBM38-205ENST00000440234 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.23■■■■□ 3.87
RBM38-205ENST00000440234 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
RBM38-205ENST00000440234 GRIN2BQ13224 1484 aa39.19■■■■□ 3.86
RBM38-205ENST00000440234 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.19■■■■□ 3.86
RBM38-205ENST00000440234 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
RBM38-205ENST00000440234 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.09■■■■□ 3.85
RBM38-205ENST00000440234 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.06■■■■□ 3.84
RBM38-205ENST00000440234 SYNJ2O15056 1496 aa39.04■■■■□ 3.84
RBM38-205ENST00000440234 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.98■■■■□ 3.83
RBM38-205ENST00000440234 ARAP1Q96P48 1450 aa38.98■■■■□ 3.83
RBM38-205ENST00000440234 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.95■■■■□ 3.83
RBM38-205ENST00000440234 SYNJ1O43426 1573 aa38.95■■■■□ 3.83
RBM38-205ENST00000440234 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.9■■■■□ 3.82
RBM38-205ENST00000440234 PBRM1Q86U86 1689 aa38.89■■■■□ 3.82
RBM38-205ENST00000440234 TOP2BQ02880 1626 aa38.86■■■■□ 3.81
RBM38-205ENST00000440234 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.82■■■■□ 3.81
RBM38-205ENST00000440234 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
RBM38-205ENST00000440234 GRIN2AQ12879 1464 aa38.66■■■■□ 3.78
RBM38-205ENST00000440234 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.62■■■■□ 3.77
RBM38-205ENST00000440234 ADAMTS12P58397 1594 aa38.59■■■■□ 3.77
RBM38-205ENST00000440234 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.56■■■■□ 3.76
RBM38-205ENST00000440234 NUP160Q12769 1436 aa38.55■■■■□ 3.76
RBM38-205ENST00000440234 CEP170Q5SW79 1584 aa38.47■■■■□ 3.75
RBM38-205ENST00000440234 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.36■■■■□ 3.73
RBM38-205ENST00000440234 SHROOM2Q13796 1616 aa38.27■■■■□ 3.72
RBM38-205ENST00000440234 JPH4Q96JJ6 628 aa38.26■■■■□ 3.72
RBM38-205ENST00000440234 IGF1RP08069 1367 aa38.22■■■■□ 3.71
RBM38-205ENST00000440234 KIF27Q86VH2 1401 aa38.21■■■■□ 3.71
RBM38-205ENST00000440234 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.2■■■■□ 3.71
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