Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RIGQ13278 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RIGQ13278 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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