RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.96■■■■□ 3.99
NHLH2-201ENST00000320238 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.47■■■■□ 3.11
NHLH2-201ENST00000320238 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.76■■■□□ 2.99
NHLH2-201ENST00000320238 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
NHLH2-201ENST00000320238 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.73■■■□□ 2.99
NHLH2-201ENST00000320238 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.57■■■□□ 2.8
NHLH2-201ENST00000320238 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.57■■■□□ 2.8
NHLH2-201ENST00000320238 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.41■■■□□ 2.78
NHLH2-201ENST00000320238 SCRIBQ14160 1630 aa32■■■□□ 2.71
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC9O60706 1549 aa31.87■■■□□ 2.69
NHLH2-201ENST00000320238 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.8■■■□□ 2.68
NHLH2-201ENST00000320238 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
NHLH2-201ENST00000320238 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.62■■■□□ 2.65
NHLH2-201ENST00000320238 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.37■■■□□ 2.61
NHLH2-201ENST00000320238 NACADO15069 1562 aa31.36■■■□□ 2.61
NHLH2-201ENST00000320238 HRCP23327 699 aa31.34■■■□□ 2.61
NHLH2-201ENST00000320238 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.34■■■□□ 2.61
NHLH2-201ENST00000320238 TRIM41Q8WV44 630 aa31.31■■■□□ 2.6
NHLH2-201ENST00000320238 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
NHLH2-201ENST00000320238 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.19■■■□□ 2.58
NHLH2-201ENST00000320238 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.17■■■□□ 2.58
NHLH2-201ENST00000320238 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
NHLH2-201ENST00000320238 WIZO95785 1651 aa30.97■■■□□ 2.55
NHLH2-201ENST00000320238 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
NHLH2-201ENST00000320238 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
NHLH2-201ENST00000320238 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
NHLH2-201ENST00000320238 SMARCA4P51532 1647 aa30.42■■■□□ 2.46
NHLH2-201ENST00000320238 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.41■■■□□ 2.46
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.39■■■□□ 2.46
NHLH2-201ENST00000320238 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC8Q09428 1581 aa30.35■■■□□ 2.45
NHLH2-201ENST00000320238 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
NHLH2-201ENST00000320238 SMARCA2P51531 1590 aa30.24■■■□□ 2.43
NHLH2-201ENST00000320238 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.14■■■□□ 2.42
NHLH2-201ENST00000320238 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
NHLH2-201ENST00000320238 SOGA1O94964 1423 aa30.09■■■□□ 2.41
NHLH2-201ENST00000320238 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.96■■■□□ 2.39
NHLH2-201ENST00000320238 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
NHLH2-201ENST00000320238 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
NHLH2-201ENST00000320238 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.88■■■□□ 2.37
NHLH2-201ENST00000320238 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
NHLH2-201ENST00000320238 CEP162Q5TB80 1403 aa29.82■■■□□ 2.36
NHLH2-201ENST00000320238 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.36
NHLH2-201ENST00000320238 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.76■■■□□ 2.35
NHLH2-201ENST00000320238 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.71■■■□□ 2.35
NHLH2-201ENST00000320238 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.69■■■□□ 2.34
NHLH2-201ENST00000320238 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
NHLH2-201ENST00000320238 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
NHLH2-201ENST00000320238 EEA1Q15075 1411 aa29.61■■■□□ 2.33
NHLH2-201ENST00000320238 SYNJ1O43426 1573 aa29.6■■■□□ 2.33
NHLH2-201ENST00000320238 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
NHLH2-201ENST00000320238 GOLGA3Q08378 1498 aa29.53■■■□□ 2.32
NHLH2-201ENST00000320238 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.36■■■□□ 2.29
NHLH2-201ENST00000320238 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.31■■■□□ 2.28
NHLH2-201ENST00000320238 CLIP1P30622 1438 aa29.29■■■□□ 2.28
NHLH2-201ENST00000320238 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
NHLH2-201ENST00000320238 KIF21BO75037 1637 aa29.2■■■□□ 2.26
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NHLH2-201ENST00000320238 APLP2Q06481 763 aa29.13■■■□□ 2.25
NHLH2-201ENST00000320238 NCAPD3P42695 1498 aa29.12■■■□□ 2.25
NHLH2-201ENST00000320238 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.08■■■□□ 2.25
NHLH2-201ENST00000320238 HMGXB3Q12766 1538 aa29■■■□□ 2.23
NHLH2-201ENST00000320238 CUX1P39880 1505 aa28.99■■■□□ 2.23
NHLH2-201ENST00000320238 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NHLH2-201ENST00000320238 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.94■■■□□ 2.22
NHLH2-201ENST00000320238 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
NHLH2-201ENST00000320238 CFTRP13569 1480 aa28.9■■■□□ 2.22
NHLH2-201ENST00000320238 PRXQ9BXM0 1461 aa28.9■■■□□ 2.22
NHLH2-201ENST00000320238 KIF27Q86VH2 1401 aa28.84■■■□□ 2.21
NHLH2-201ENST00000320238 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
NHLH2-201ENST00000320238 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
NHLH2-201ENST00000320238 ARAP1Q96P48 1450 aa28.77■■■□□ 2.2
NHLH2-201ENST00000320238 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.75■■■□□ 2.19
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
NHLH2-201ENST00000320238 NEUROD1Q13562 356 aa28.68■■■□□ 2.18
NHLH2-201ENST00000320238 CUX2O14529 1486 aa28.67■■■□□ 2.18
NHLH2-201ENST00000320238 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.66■■■□□ 2.18
NHLH2-201ENST00000320238 IGF1RP08069 1367 aa28.6■■■□□ 2.17
NHLH2-201ENST00000320238 ITGAEP38570 1179 aa28.59■■■□□ 2.17
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NHLH2-201ENST00000320238 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.51■■■□□ 2.15
NHLH2-201ENST00000320238 P3H3Q8IVL6 736 aa28.5■■■□□ 2.15
NHLH2-201ENST00000320238 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
NHLH2-201ENST00000320238 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.49■■■□□ 2.15
NHLH2-201ENST00000320238 MIER1Q8N108 512 aa28.42■■■□□ 2.14
NHLH2-201ENST00000320238 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
NHLH2-201ENST00000320238 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
NHLH2-201ENST00000320238 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
NHLH2-201ENST00000320238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.4■■■□□ 2.14
NHLH2-201ENST00000320238 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.37■■■□□ 2.13
NHLH2-201ENST00000320238 NESP48681 1621 aa28.36■■■□□ 2.13
NHLH2-201ENST00000320238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.36■■■□□ 2.13
NHLH2-201ENST00000320238 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.35■■■□□ 2.13
NHLH2-201ENST00000320238 PRDM2Q13029 1718 aa28.34■■■□□ 2.13
NHLH2-201ENST00000320238 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
NHLH2-201ENST00000320238 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.24■■■□□ 2.11
NHLH2-201ENST00000320238 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
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