Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TGFBR1P36897 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms