RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263960.6

COQ10B-201, Transcript of coenzyme Q10B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COQ10B, Length 2,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10B-201ENST00000263960 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.79■■■■□ 3.96
COQ10B-201ENST00000263960 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.04■■■■□ 3.04
COQ10B-201ENST00000263960 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
COQ10B-201ENST00000263960 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.49■■■□□ 2.95
COQ10B-201ENST00000263960 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.8■■■□□ 2.84
COQ10B-201ENST00000263960 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.75■■■□□ 2.83
COQ10B-201ENST00000263960 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
COQ10B-201ENST00000263960 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.92■■■□□ 2.7
COQ10B-201ENST00000263960 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.82■■■□□ 2.68
COQ10B-201ENST00000263960 SCRIBQ14160 1630 aa31.69■■■□□ 2.66
COQ10B-201ENST00000263960 ABCC9O60706 1549 aa31.64■■■□□ 2.66
COQ10B-201ENST00000263960 NACADO15069 1562 aa31.5■■■□□ 2.63
COQ10B-201ENST00000263960 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
COQ10B-201ENST00000263960 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31■■■□□ 2.55
COQ10B-201ENST00000263960 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.98■■■□□ 2.55
COQ10B-201ENST00000263960 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.88■■■□□ 2.53
COQ10B-201ENST00000263960 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.78■■■□□ 2.52
COQ10B-201ENST00000263960 WIZO95785 1651 aa30.69■■■□□ 2.5
COQ10B-201ENST00000263960 TRIM41Q8WV44 630 aa30.58■■■□□ 2.49
COQ10B-201ENST00000263960 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.49
COQ10B-201ENST00000263960 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.56■■■□□ 2.48
COQ10B-201ENST00000263960 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.45■■■□□ 2.47
COQ10B-201ENST00000263960 HRCP23327 699 aa30.36■■■□□ 2.45
COQ10B-201ENST00000263960 SMARCA4P51532 1647 aa30.35■■■□□ 2.45
COQ10B-201ENST00000263960 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
COQ10B-201ENST00000263960 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
COQ10B-201ENST00000263960 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
COQ10B-201ENST00000263960 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.18■■■□□ 2.42
COQ10B-201ENST00000263960 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.09■■■□□ 2.41
COQ10B-201ENST00000263960 SMARCA2P51531 1590 aa30.07■■■□□ 2.4
COQ10B-201ENST00000263960 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
COQ10B-201ENST00000263960 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
COQ10B-201ENST00000263960 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.87■■■□□ 2.37
COQ10B-201ENST00000263960 ABCC8Q09428 1581 aa29.86■■■□□ 2.37
COQ10B-201ENST00000263960 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.86■■■□□ 2.37
COQ10B-201ENST00000263960 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
COQ10B-201ENST00000263960 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.62■■■□□ 2.33
COQ10B-201ENST00000263960 SOGA1O94964 1423 aa29.53■■■□□ 2.32
COQ10B-201ENST00000263960 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
COQ10B-201ENST00000263960 EEA1Q15075 1411 aa29.45■■■□□ 2.3
COQ10B-201ENST00000263960 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
COQ10B-201ENST00000263960 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.41■■■□□ 2.3
COQ10B-201ENST00000263960 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.37■■■□□ 2.29
COQ10B-201ENST00000263960 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.32■■■□□ 2.28
COQ10B-201ENST00000263960 SYNJ1O43426 1573 aa29.31■■■□□ 2.28
COQ10B-201ENST00000263960 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
COQ10B-201ENST00000263960 CEP162Q5TB80 1403 aa29.29■■■□□ 2.28
COQ10B-201ENST00000263960 GOLGA3Q08378 1498 aa29.18■■■□□ 2.26
COQ10B-201ENST00000263960 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
COQ10B-201ENST00000263960 NCAPD3P42695 1498 aa29.14■■■□□ 2.25
COQ10B-201ENST00000263960 HMGXB3Q12766 1538 aa29.11■■■□□ 2.25
COQ10B-201ENST00000263960 KIF21BO75037 1637 aa29.06■■■□□ 2.24
COQ10B-201ENST00000263960 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.05■■■□□ 2.24
COQ10B-201ENST00000263960 TOP2BQ02880 1626 aa29.03■■■□□ 2.24
COQ10B-201ENST00000263960 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.96■■■□□ 2.23
COQ10B-201ENST00000263960 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
COQ10B-201ENST00000263960 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.84■■■□□ 2.21
COQ10B-201ENST00000263960 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
COQ10B-201ENST00000263960 CLIP1P30622 1438 aa28.8■■■□□ 2.2
COQ10B-201ENST00000263960 CFTRP13569 1480 aa28.8■■■□□ 2.2
COQ10B-201ENST00000263960 CUX1P39880 1505 aa28.77■■■□□ 2.2
COQ10B-201ENST00000263960 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
COQ10B-201ENST00000263960 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.67■■■□□ 2.18
COQ10B-201ENST00000263960 PRXQ9BXM0 1461 aa28.66■■■□□ 2.18
COQ10B-201ENST00000263960 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.65■■■□□ 2.18
COQ10B-201ENST00000263960 PRDM2Q13029 1718 aa28.63■■■□□ 2.17
COQ10B-201ENST00000263960 KIF27Q86VH2 1401 aa28.56■■■□□ 2.16
COQ10B-201ENST00000263960 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.51■■■□□ 2.15
COQ10B-201ENST00000263960 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
COQ10B-201ENST00000263960 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.48■■■□□ 2.15
COQ10B-201ENST00000263960 APLP2Q06481 763 aa28.44■■■□□ 2.14
COQ10B-201ENST00000263960 ARAP1Q96P48 1450 aa28.41■■■□□ 2.14
COQ10B-201ENST00000263960 CUX2O14529 1486 aa28.31■■■□□ 2.12
COQ10B-201ENST00000263960 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
COQ10B-201ENST00000263960 IGF1RP08069 1367 aa28.29■■■□□ 2.12
COQ10B-201ENST00000263960 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.28■■■□□ 2.12
COQ10B-201ENST00000263960 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.21■■■□□ 2.11
COQ10B-201ENST00000263960 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.2■■■□□ 2.11
COQ10B-201ENST00000263960 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
COQ10B-201ENST00000263960 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.14■■■□□ 2.1
COQ10B-201ENST00000263960 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.08■■■□□ 2.09
COQ10B-201ENST00000263960 NESP48681 1621 aa28.06■■■□□ 2.08
COQ10B-201ENST00000263960 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
COQ10B-201ENST00000263960 TOPBP1Q92547 1522 aa28.02■■■□□ 2.08
COQ10B-201ENST00000263960 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28■■■□□ 2.07
COQ10B-201ENST00000263960 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
COQ10B-201ENST00000263960 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.99■■■□□ 2.07
COQ10B-201ENST00000263960 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
COQ10B-201ENST00000263960 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
COQ10B-201ENST00000263960 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.92■■■□□ 2.06
COQ10B-201ENST00000263960 MAP3K1Q13233 1512 aa27.9■■■□□ 2.06
COQ10B-201ENST00000263960 TIAM1Q13009 1591 aa27.87■■■□□ 2.05
COQ10B-201ENST00000263960 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.84■■■□□ 2.05
COQ10B-201ENST00000263960 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
COQ10B-201ENST00000263960 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
COQ10B-201ENST00000263960 CUL7Q14999 1698 aa27.82■■■□□ 2.04
COQ10B-201ENST00000263960 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.81■■■□□ 2.04
COQ10B-201ENST00000263960 WDR97A6NE52 1622 aa27.79■■■□□ 2.04
COQ10B-201ENST00000263960 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.78■■■□□ 2.04
COQ10B-201ENST00000263960 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms