Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TGFBR1P36897 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TGFBR1P36897 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TGFBR1P36897 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TGFBR1P36897 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TGFBR1P36897 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TGFBR1P36897 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TGFBR1P36897 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TGFBR1P36897 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TGFBR1P36897 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TGFBR1P36897 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGFBR1P36897 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGFBR1P36897 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TGFBR1P36897 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGFBR1P36897 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TGFBR1P36897 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGFBR1P36897 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TGFBR1P36897 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGFBR1P36897 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TGFBR1P36897 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGFBR1P36897 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGFBR1P36897 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGFBR1P36897 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TGFBR1P36897 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGFBR1P36897 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TGFBR1P36897 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TGFBR1P36897 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TGFBR1P36897 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TGFBR1P36897 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGFBR1P36897 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGFBR1P36897 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGFBR1P36897 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGFBR1P36897 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFBR1P36897 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFBR1P36897 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFBR1P36897 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFBR1P36897 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFBR1P36897 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFBR1P36897 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGFBR1P36897 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGFBR1P36897 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGFBR1P36897 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGFBR1P36897 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TGFBR1P36897 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TGFBR1P36897 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TGFBR1P36897 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TGFBR1P36897 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TGFBR1P36897 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGFBR1P36897 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TGFBR1P36897 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TGFBR1P36897 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TGFBR1P36897 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TGFBR1P36897 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TGFBR1P36897 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TGFBR1P36897 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TGFBR1P36897 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFBR1P36897 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFBR1P36897 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFBR1P36897 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFBR1P36897 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFBR1P36897 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TGFBR1P36897 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TGFBR1P36897 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFBR1P36897 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TGFBR1P36897 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TGFBR1P36897 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFBR1P36897 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFBR1P36897 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TGFBR1P36897 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TGFBR1P36897 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TGFBR1P36897 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFBR1P36897 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGFBR1P36897 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGFBR1P36897 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFBR1P36897 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFBR1P36897 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFBR1P36897 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TGFBR1P36897 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGFBR1P36897 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGFBR1P36897 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGFBR1P36897 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFBR1P36897 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGFBR1P36897 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGFBR1P36897 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGFBR1P36897 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGFBR1P36897 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGFBR1P36897 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFBR1P36897 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFBR1P36897 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGFBR1P36897 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGFBR1P36897 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGFBR1P36897 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFBR1P36897 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFBR1P36897 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms