Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms